130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2272 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  100 
 
 
403 aa  804    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.26 
 
 
554 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  41.69 
 
 
776 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.95 
 
 
417 aa  212  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  41.14 
 
 
778 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  42.09 
 
 
579 aa  206  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  41.26 
 
 
792 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  40.76 
 
 
784 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.7 
 
 
563 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  40.22 
 
 
477 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.82 
 
 
556 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.82 
 
 
561 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.18 
 
 
567 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  42.49 
 
 
560 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.59 
 
 
555 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  39.94 
 
 
551 aa  190  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  40.94 
 
 
569 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  38.55 
 
 
558 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.38 
 
 
570 aa  186  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  38.46 
 
 
553 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  40.78 
 
 
546 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.4 
 
 
837 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.94 
 
 
1919 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.44 
 
 
818 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  36.03 
 
 
554 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.7 
 
 
821 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  39.66 
 
 
558 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  39.64 
 
 
577 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  35.26 
 
 
2082 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.89 
 
 
1679 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  38.48 
 
 
566 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  35.8 
 
 
911 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.89 
 
 
555 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  36.2 
 
 
717 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  34.22 
 
 
1129 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  33.99 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  36.68 
 
 
714 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  34.46 
 
 
389 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  35.65 
 
 
593 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.71 
 
 
469 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.22 
 
 
1848 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  32.96 
 
 
461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  38.16 
 
 
681 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  33.77 
 
 
449 aa  137  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.59 
 
 
553 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.86 
 
 
706 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  32.21 
 
 
743 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  35.39 
 
 
835 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  36.45 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.15 
 
 
941 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.16 
 
 
454 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.47 
 
 
737 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.14 
 
 
1147 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  28.42 
 
 
1207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.77 
 
 
692 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.2 
 
 
787 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  28.76 
 
 
807 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  31.64 
 
 
643 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  31.72 
 
 
726 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  27.76 
 
 
363 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  32.05 
 
 
443 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  27.76 
 
 
363 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.41 
 
 
810 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  33.01 
 
 
638 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.69 
 
 
817 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  32.26 
 
 
602 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  28.91 
 
 
1187 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  30.79 
 
 
450 aa  99.8  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.17 
 
 
209 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
745 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  29.57 
 
 
618 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  33.12 
 
 
624 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  30.7 
 
 
328 aa  94.7  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.19 
 
 
900 aa  93.6  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  25.53 
 
 
341 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  29.09 
 
 
544 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  28.33 
 
 
547 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  25.81 
 
 
499 aa  91.3  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  32.17 
 
 
332 aa  91.3  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  31.45 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  29.32 
 
 
390 aa  89.7  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.02 
 
 
535 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  32.71 
 
 
558 aa  87  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  38.36 
 
 
1222 aa  86.7  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  30.13 
 
 
547 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  26.94 
 
 
375 aa  84  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  32.05 
 
 
597 aa  83.2  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  38.32 
 
 
375 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.57 
 
 
1126 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  27.52 
 
 
575 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  29.06 
 
 
728 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  28.48 
 
 
454 aa  77  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  29.33 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  26.33 
 
 
1312 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  27.72 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  25.38 
 
 
533 aa  73.2  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  25.45 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  26.37 
 
 
657 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  26.76 
 
 
643 aa  69.7  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  27.03 
 
 
727 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>