227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1922 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 		 1222 aa  2402    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  42.16 
 
 		 921 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  35.82 
 
 		 743 aa  301  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  55.2 
 
 		 624 aa  263  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.02 
 
 		 837 aa  253  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.33 
 
 		 821 aa  244  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.82 
 
 		 1919 aa  240  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  36.12 
 
 		 792 aa  230  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  34.94 
 
 		 778 aa  229  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  34.36 
 
 		 784 aa  229  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.11 
 
 		 818 aa  228  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  34.85 
 
 		 776 aa  221  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  32.28 
 
 		 717 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 2082 aa  208  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  34.04 
 
 		 714 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  27.06 
 
 		 911 aa  181  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  44.09 
 
 		 307 aa  172  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  27.97 
 
 		 807 aa  157  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  40 
 
 		 2816 aa  156  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.19 
 
 		 692 aa  153  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  54.89 
 
 		 1679 aa  151  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  34.16 
 
 		 593 aa  150  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  38.01 
 
 		 298 aa  146  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  35.33 
 
 		 363 aa  145  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  35.33 
 
 		 363 aa  145  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  52.7 
 
 		 461 aa  145  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  36.84 
 
 		 295 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  36.46 
 
 		 1178 aa  142  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  37.87 
 
 		 295 aa  142  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  34.44 
 
 		 726 aa  140  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  32.63 
 
 		 1129 aa  140  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  50 
 
 		 547 aa  135  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  32.86 
 
 		 1107 aa  135  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.75 
 
 		 469 aa  135  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  51.97 
 
 		 461 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  33.68 
 
 		 835 aa  134  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.08 
 
 		 900 aa  131  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1928  hypothetical protein  39.5 
 
 		 260 aa  129  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0196407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  33.72 
 
 		 681 aa  129  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  32.69 
 
 		 1408 aa  127  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.87 
 
 		 1848 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  35.22 
 
 		 579 aa  127  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05390  hypothetical protein  34.87 
 
 		 297 aa  127  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  37.46 
 
 		 569 aa  126  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.68 
 
 		 555 aa  126  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.81 
 
 		 567 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  26.67 
 
 		 1187 aa  124  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  32.04 
 
 		 546 aa  124  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.13 
 
 		 553 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  47.33 
 
 		 449 aa  122  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.86 
 
 		 556 aa  121  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.04 
 
 		 561 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  25.74 
 
 		 1207 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1474  hypothetical protein  41.82 
 
 		 383 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.53 
 
 		 417 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16110  hypothetical protein  37.45 
 
 		 280 aa  119  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.83 
 
 		 563 aa  118  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19690  hypothetical protein  37.09 
 
 		 285 aa  118  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0713543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  32.84 
 
 		 558 aa  117  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  33.9 
 
 		 477 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  52.54 
 
 		 376 aa  115  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.65 
 
 		 555 aa  115  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.39 
 
 		 554 aa  114  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  37 
 
 		 551 aa  115  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  32.49 
 
 		 1410 aa  112  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  32.49 
 
 		 1410 aa  112  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.89 
 
 		 570 aa  111  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  34.78 
 
 		 553 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1108 aa  110  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  30.84 
 
 		 443 aa  110  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  32.41 
 
 		 560 aa  109  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.18 
 
 		 706 aa  109  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  29.97 
 
 		 826 aa  108  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  32.6 
 
 		 577 aa  107  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  28.5 
 
 		 14609 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.22 
 
 		 1126 aa  105  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  34.58 
 
 		 554 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  31.25 
 
 		 558 aa  103  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  28.8 
 
 		 597 aa  102  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  31.56 
 
 		 566 aa  99.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  26.72 
 
 		 576 aa  96.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  29.37 
 
 		 1422 aa  94  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  34.15 
 
 		 1951 aa  93.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  27.33 
 
 		 576 aa  93.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  26.62 
 
 		 576 aa  91.7  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  50 
 
 		 1657 aa  91.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  28.98 
 
 		 501 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  33.78 
 
 		 389 aa  89.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  26.7 
 
 		 526 aa  89  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  38.36 
 
 		 403 aa  86.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  32.93 
 
 		 618 aa  85.5  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  27.19 
 
 		 533 aa  84  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.76 
 
 		 787 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.33 
 
 		 535 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.25 
 
 		 817 aa  83.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.21 
 
 		 941 aa  82.4  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.11 
 
 		 658 aa  82  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  27.06 
 
 		 602 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  46.84 
 
 		 106 aa  80.9  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.58 
 
 		 810 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>