255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1475 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  100 
 
 
1919 aa  3824    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.42 
 
 
692 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  50.93 
 
 
1679 aa  330  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.94 
 
 
821 aa  316  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.42 
 
 
818 aa  294  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  40.39 
 
 
911 aa  288  9e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  41.27 
 
 
461 aa  280  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  40.57 
 
 
461 aa  280  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.38 
 
 
837 aa  275  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  39.94 
 
 
807 aa  257  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  42.08 
 
 
2082 aa  251  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  41.1 
 
 
1222 aa  251  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  41.78 
 
 
547 aa  244  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  44.18 
 
 
449 aa  241  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  39.61 
 
 
778 aa  237  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  44.96 
 
 
717 aa  236  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  41.16 
 
 
714 aa  234  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  41.21 
 
 
743 aa  233  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  40.05 
 
 
792 aa  225  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  39.5 
 
 
784 aa  224  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  33.27 
 
 
776 aa  212  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.1 
 
 
554 aa  210  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.34 
 
 
561 aa  210  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.1 
 
 
469 aa  205  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  36.86 
 
 
558 aa  204  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  37.43 
 
 
1129 aa  200  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  37.2 
 
 
579 aa  200  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.68 
 
 
555 aa  200  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  39.6 
 
 
569 aa  199  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.52 
 
 
563 aa  197  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  36.52 
 
 
546 aa  194  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  36.31 
 
 
363 aa  193  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  36.31 
 
 
363 aa  193  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.26 
 
 
555 aa  191  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.51 
 
 
567 aa  190  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  35.84 
 
 
553 aa  190  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  33.59 
 
 
560 aa  189  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  36.42 
 
 
593 aa  188  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.84 
 
 
417 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.39 
 
 
570 aa  187  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  35.96 
 
 
477 aa  187  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  37.9 
 
 
1848 aa  185  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  33.91 
 
 
551 aa  182  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  38.03 
 
 
376 aa  181  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.51 
 
 
553 aa  181  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  38.19 
 
 
577 aa  179  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  39.43 
 
 
681 aa  178  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  36.34 
 
 
726 aa  176  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.1 
 
 
556 aa  174  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  35.47 
 
 
554 aa  173  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  33.85 
 
 
835 aa  172  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  36.94 
 
 
403 aa  171  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  37.17 
 
 
1126 aa  171  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  36.75 
 
 
566 aa  166  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  37.92 
 
 
558 aa  166  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  42.31 
 
 
1657 aa  161  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.4 
 
 
706 aa  157  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.78 
 
 
737 aa  151  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32 
 
 
900 aa  145  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  34.78 
 
 
624 aa  142  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  34.23 
 
 
618 aa  140  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  33.33 
 
 
597 aa  139  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  32.96 
 
 
389 aa  139  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  27.79 
 
 
575 aa  138  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  33.96 
 
 
443 aa  138  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.3 
 
 
810 aa  135  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  30.5 
 
 
643 aa  129  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.09 
 
 
921 aa  125  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  27.25 
 
 
396 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.39 
 
 
2816 aa  123  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  31.43 
 
 
1951 aa  122  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.37 
 
 
787 aa  120  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  33.45 
 
 
638 aa  119  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 
745 aa  118  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  27.92 
 
 
450 aa  118  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  30.53 
 
 
1187 aa  116  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.61 
 
 
817 aa  115  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  29.82 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.76 
 
 
454 aa  113  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  30.82 
 
 
602 aa  112  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  29.03 
 
 
418 aa  112  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.41 
 
 
941 aa  112  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.92 
 
 
535 aa  111  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  28.27 
 
 
728 aa  111  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  27.3 
 
 
1207 aa  109  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  32.97 
 
 
558 aa  107  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  31.36 
 
 
544 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.26 
 
 
1147 aa  103  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  29.92 
 
 
2117 aa  101  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  35.12 
 
 
298 aa  98.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  26.97 
 
 
371 aa  97.1  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  35.18 
 
 
3586 aa  96.3  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  30.08 
 
 
328 aa  95.5  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  32.55 
 
 
332 aa  95.9  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  33.2 
 
 
295 aa  93.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  27.27 
 
 
1312 aa  91.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  30.58 
 
 
2528 aa  91.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  32.17 
 
 
295 aa  91.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  55 
 
 
106 aa  92  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  32.98 
 
 
5743 aa  89.4  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>