124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3566 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  100 
 
 
728 aa  1503    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  27.03 
 
 
784 aa  195  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  27.53 
 
 
778 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  26.28 
 
 
776 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  25.72 
 
 
792 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  23.52 
 
 
743 aa  153  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  22.63 
 
 
821 aa  147  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  22.82 
 
 
818 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.19 
 
 
554 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.7 
 
 
837 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  30.72 
 
 
569 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  30.03 
 
 
477 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  25.04 
 
 
911 aa  123  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  31.55 
 
 
546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.5 
 
 
556 aa  122  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  24.44 
 
 
2082 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  25.07 
 
 
461 aa  117  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  28.1 
 
 
579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.61 
 
 
555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  30.14 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.27 
 
 
1919 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.57 
 
 
706 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.65 
 
 
567 aa  111  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  28.48 
 
 
551 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.26 
 
 
555 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  22.57 
 
 
714 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.8 
 
 
561 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  28.66 
 
 
560 aa  107  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  23.67 
 
 
1187 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  23.12 
 
 
717 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  29.45 
 
 
577 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  27.21 
 
 
553 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  28.57 
 
 
558 aa  105  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.5 
 
 
563 aa  105  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.92 
 
 
570 aa  104  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  26.88 
 
 
737 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  25 
 
 
341 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  26.36 
 
 
469 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  27.08 
 
 
566 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  29.22 
 
 
554 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  24.93 
 
 
363 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  24.93 
 
 
363 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  26.02 
 
 
461 aa  96.3  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  23.36 
 
 
1207 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  27.27 
 
 
328 aa  93.2  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.3 
 
 
553 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.61 
 
 
787 aa  91.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  20.86 
 
 
807 aa  90.1  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  24.59 
 
 
449 aa  90.1  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.26 
 
 
417 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  27.63 
 
 
900 aa  89  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  26.8 
 
 
1848 aa  87  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  33.33 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.15 
 
 
1679 aa  86.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  30.04 
 
 
593 aa  85.5  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.62 
 
 
817 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  26.22 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  30.58 
 
 
681 aa  84  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  23.61 
 
 
1129 aa  83.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  27.31 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  23.98 
 
 
726 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.6 
 
 
941 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  29.06 
 
 
403 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  28.41 
 
 
638 aa  79.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  27.7 
 
 
643 aa  78.2  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  24.87 
 
 
727 aa  78.2  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  23.48 
 
 
745 aa  76.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  26.11 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  28.76 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  25.15 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  26.73 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  22.87 
 
 
547 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  26.98 
 
 
547 aa  73.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.86 
 
 
810 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  25 
 
 
618 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  26.27 
 
 
602 aa  70.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  25.33 
 
 
835 aa  70.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  25.93 
 
 
376 aa  70.5  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  23.44 
 
 
1222 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  34.06 
 
 
533 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  24.04 
 
 
575 aa  68.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  26.47 
 
 
558 aa  68.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  25.07 
 
 
499 aa  67.8  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  22.89 
 
 
535 aa  68.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  33.85 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  25.93 
 
 
544 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  25.48 
 
 
390 aa  65.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  24.23 
 
 
590 aa  65.1  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.17 
 
 
1147 aa  63.9  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  35 
 
 
209 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  22.13 
 
 
921 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.79 
 
 
692 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  32.43 
 
 
394 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  23.06 
 
 
643 aa  62.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  22.29 
 
 
298 aa  60.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47675  predicted protein  27.72 
 
 
491 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  22.75 
 
 
447 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  23.64 
 
 
454 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6750  predicted protein  27.67 
 
 
212 aa  58.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0046022  normal  0.726599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  24.01 
 
 
624 aa  57  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>