158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1394 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  100 
 
 
1126 aa  2258    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  83.95 
 
 
810 aa  533  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  58.97 
 
 
540 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  62.72 
 
 
826 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  60.62 
 
 
633 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  60.41 
 
 
1178 aa  396  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  60.4 
 
 
714 aa  393  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  54.19 
 
 
1026 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  63.29 
 
 
701 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  56.13 
 
 
408 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  57.59 
 
 
920 aa  370  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  57.47 
 
 
1221 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  50.89 
 
 
884 aa  357  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.14 
 
 
805 aa  355  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  48.46 
 
 
721 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  53.54 
 
 
640 aa  344  5.999999999999999e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.2 
 
 
1607 aa  340  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  55.27 
 
 
2802 aa  339  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  53.97 
 
 
1848 aa  335  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  53.98 
 
 
1255 aa  332  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  48.5 
 
 
1195 aa  327  9e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.29 
 
 
1130 aa  323  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.83 
 
 
1383 aa  317  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.41 
 
 
887 aa  310  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.36 
 
 
1183 aa  308  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  57.66 
 
 
1285 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  48.1 
 
 
1176 aa  295  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.97 
 
 
1507 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  51.75 
 
 
862 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.51 
 
 
821 aa  283  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.45 
 
 
1292 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  52.26 
 
 
933 aa  274  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  48.38 
 
 
462 aa  271  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.17 
 
 
1176 aa  271  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.2 
 
 
664 aa  270  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  46.85 
 
 
791 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  33.33 
 
 
911 aa  266  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  45.48 
 
 
3563 aa  265  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  32.27 
 
 
717 aa  254  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.9 
 
 
818 aa  253  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  49.06 
 
 
648 aa  246  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  33.1 
 
 
714 aa  244  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  30.84 
 
 
2082 aa  241  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  30.25 
 
 
792 aa  219  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  29.6 
 
 
784 aa  213  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  29.32 
 
 
778 aa  201  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  27.17 
 
 
743 aa  188  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  29.89 
 
 
776 aa  180  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  40.15 
 
 
288 aa  179  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  26.65 
 
 
807 aa  178  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.28 
 
 
837 aa  167  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.66 
 
 
1919 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  33.98 
 
 
461 aa  159  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.74 
 
 
1679 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  44.91 
 
 
1083 aa  151  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  32.67 
 
 
1129 aa  141  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  31.64 
 
 
449 aa  140  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  32.11 
 
 
461 aa  138  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  34.2 
 
 
363 aa  128  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  34.2 
 
 
363 aa  127  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  37.89 
 
 
547 aa  127  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.43 
 
 
469 aa  118  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  32.03 
 
 
569 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.44 
 
 
554 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.64 
 
 
561 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  33 
 
 
558 aa  108  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.66 
 
 
563 aa  108  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  32.01 
 
 
477 aa  107  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.3 
 
 
692 aa  106  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.75 
 
 
417 aa  106  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  26.22 
 
 
1222 aa  105  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  32.53 
 
 
553 aa  105  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  28.16 
 
 
726 aa  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  31.93 
 
 
546 aa  103  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.4 
 
 
555 aa  99.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.94 
 
 
555 aa  98.6  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  28.85 
 
 
593 aa  98.2  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.78 
 
 
810 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  32.84 
 
 
579 aa  96.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  32.43 
 
 
577 aa  95.1  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  30.2 
 
 
558 aa  95.1  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.89 
 
 
567 aa  94.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3336  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein  29.01 
 
 
787 aa  94  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0329371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.37 
 
 
570 aa  93.2  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  34.06 
 
 
551 aa  93.2  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  29.31 
 
 
560 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.24 
 
 
706 aa  92.8  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  29.38 
 
 
835 aa  93.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  31.61 
 
 
681 aa  90.9  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.29 
 
 
556 aa  88.6  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  28.05 
 
 
597 aa  86.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  34.73 
 
 
376 aa  84.7  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.46 
 
 
737 aa  82.8  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.63 
 
 
553 aa  81.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  28.57 
 
 
403 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.15 
 
 
2816 aa  79.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  24.67 
 
 
643 aa  78.6  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  25.36 
 
 
900 aa  77.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  28.64 
 
 
298 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  28.18 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>