113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1010 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  100 
 
 
597 aa  1194    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  33.87 
 
 
743 aa  158  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.62 
 
 
818 aa  146  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.07 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
1919 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.27 
 
 
821 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  34.57 
 
 
776 aa  137  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  31.91 
 
 
1129 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  32.02 
 
 
778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  32.45 
 
 
784 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  29.68 
 
 
461 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.55 
 
 
1679 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  31.93 
 
 
714 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  29.87 
 
 
911 aa  124  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  33.59 
 
 
2082 aa  124  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  31.12 
 
 
726 aa  122  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.55 
 
 
837 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  30.89 
 
 
835 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  30.27 
 
 
717 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  26.46 
 
 
363 aa  117  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  26.46 
 
 
363 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  27.8 
 
 
807 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  29.13 
 
 
461 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  32.18 
 
 
792 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  30.03 
 
 
593 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  32.43 
 
 
547 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  32.35 
 
 
1222 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.06 
 
 
417 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.77 
 
 
1848 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.75 
 
 
555 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.67 
 
 
706 aa  95.9  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  32.21 
 
 
477 aa  94.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  29.12 
 
 
443 aa  94  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.95 
 
 
554 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.16 
 
 
810 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.98 
 
 
561 aa  90.9  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  31.02 
 
 
579 aa  89.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  29.58 
 
 
551 aa  88.6  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  30.03 
 
 
558 aa  88.2  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  28.75 
 
 
624 aa  87  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  31.11 
 
 
681 aa  87  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.16 
 
 
692 aa  87  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  31.17 
 
 
569 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.05 
 
 
1126 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  26.55 
 
 
449 aa  85.9  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.68 
 
 
553 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  32.05 
 
 
403 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  31.91 
 
 
553 aa  81.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  29.51 
 
 
546 aa  80.9  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.96 
 
 
555 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.89 
 
 
567 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.68 
 
 
570 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  26.67 
 
 
737 aa  77.8  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  29.63 
 
 
376 aa  76.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.23 
 
 
921 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.11 
 
 
556 aa  73.9  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  29.49 
 
 
560 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  30.59 
 
 
558 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  37.23 
 
 
106 aa  71.6  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  26.67 
 
 
558 aa  70.5  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.28 
 
 
563 aa  70.5  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.77 
 
 
900 aa  70.1  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  27.68 
 
 
566 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  28.96 
 
 
389 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  28.48 
 
 
418 aa  67  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.06 
 
 
941 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  37.5 
 
 
307 aa  64.3  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  26.24 
 
 
533 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  29.67 
 
 
332 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  29.72 
 
 
544 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  27.88 
 
 
577 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  32.2 
 
 
554 aa  62.4  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  28 
 
 
1207 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  26.23 
 
 
590 aa  61.6  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  25.45 
 
 
371 aa  61.2  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  25.57 
 
 
341 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  23.97 
 
 
375 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  25.42 
 
 
1187 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  23.61 
 
 
396 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  24.85 
 
 
328 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  26.3 
 
 
390 aa  58.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.15 
 
 
817 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  32.66 
 
 
618 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.35 
 
 
535 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.24 
 
 
787 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  27.42 
 
 
375 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  29.46 
 
 
447 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.48 
 
 
454 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.24 
 
 
326 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  29.87 
 
 
1312 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  27.08 
 
 
727 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  26.95 
 
 
499 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  35 
 
 
643 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  25.81 
 
 
643 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40439  predicted protein  30.07 
 
 
160 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0503657 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47675  predicted protein  25.71 
 
 
491 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3336  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein  29.83 
 
 
787 aa  48.5  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0329371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  24.43 
 
 
298 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  25.68 
 
 
1408 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  24.77 
 
 
783 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0561113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>