99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47675 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47675  predicted protein  100 
 
 		 491 aa  1011    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  25.29 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  30.32 
 
 		 569 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  28.96 
 
 		 546 aa  73.6  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  27.93 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  26.84 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.55 
 
 		 706 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  32.88 
 
 		 778 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  31.31 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  30.34 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  31.65 
 
 		 792 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.28 
 
 		 555 aa  70.5  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  28 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  31.1 
 
 		 776 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  28.76 
 
 		 579 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  29.86 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.04 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  24.18 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.37 
 
 		 941 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  26.09 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  29.3 
 
 		 1187 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.33 
 
 		 1848 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.25 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  25.97 
 
 		 1207 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  26.8 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  25.25 
 
 		 1312 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.74 
 
 		 900 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.32 
 
 		 561 aa  60.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.37 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.55 
 
 		 837 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.48 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  25.97 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.54 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.24 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  26.42 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  26.9 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.92 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.29 
 
 		 787 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  31.03 
 
 		 577 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  29.8 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.56 
 
 		 817 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  25.71 
 
 		 737 aa  57  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  26.19 
 
 		 363 aa  57  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  26.19 
 
 		 363 aa  57  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  28.19 
 
 		 726 aa  56.6  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  27 
 
 		 443 aa  57  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.76 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36476  predicted protein  27.85 
 
 		 520 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  27.19 
 
 		 558 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  24.71 
 
 		 558 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  28.28 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51473  predicted protein  26.95 
 
 		 1448 aa  55.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  29.82 
 
 		 727 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  26.79 
 
 		 560 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.27 
 
 		 553 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.1 
 
 		 818 aa  53.9  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 454 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.27 
 
 		 810 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  30.49 
 
 		 618 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  26.05 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.68 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  23.1 
 
 		 558 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  24.14 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32200  predicted protein  27.78 
 
 		 220 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.457175 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  23.81 
 
 		 590 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  23.11 
 
 		 533 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  24.55 
 
 		 783 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  26.98 
 
 		 332 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  25.96 
 
 		 643 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  29.85 
 
 		 547 aa  50.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 403 aa  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  27 
 
 		 643 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  21.43 
 
 		 461 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  21.15 
 
 		 911 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  23.93 
 
 		 714 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.56 
 
 		 1147 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30 
 
 		 326 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  25.71 
 
 		 597 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  30.28 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  25.56 
 
 		 717 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43296  predicted protein  31.68 
 
 		 370 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02874  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 		 1365 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.46357 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  28.22 
 
 		 418 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  28.57 
 
 		 681 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40439  predicted protein  26.85 
 
 		 160 aa  47  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0503657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.07 
 
 		 1679 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  27.22 
 
 		 566 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  22.53 
 
 		 821 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  24.52 
 
 		 657 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6750  predicted protein  38.78 
 
 		 212 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0046022  normal  0.726599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  25.29 
 
 		 638 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  31.25 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  20.93 
 
 		 692 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 547 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.28 
 
 		 209 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  23.02 
 
 		 450 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  21.18 
 
 		 449 aa  43.9  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 2082 aa  43.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>