116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF04720 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  100 
 
 
590 aa  1205    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  31.77 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  38.14 
 
 
533 aa  213  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  32.53 
 
 
547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  25.32 
 
 
778 aa  110  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  26.24 
 
 
743 aa  101  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.76 
 
 
821 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.55 
 
 
554 aa  97.1  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  25.06 
 
 
792 aa  94  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  28.04 
 
 
1207 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.86 
 
 
818 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  28.22 
 
 
579 aa  92  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  24.83 
 
 
477 aa  91.3  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.4 
 
 
555 aa  90.9  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  22.53 
 
 
784 aa  88.6  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.53 
 
 
561 aa  87  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  31.44 
 
 
546 aa  87  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  31.41 
 
 
554 aa  87  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  29.24 
 
 
375 aa  86.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.57 
 
 
837 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  29.01 
 
 
418 aa  85.5  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.72 
 
 
706 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  25.19 
 
 
569 aa  85.1  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  24.77 
 
 
558 aa  84.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  25.23 
 
 
341 aa  84  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.04 
 
 
941 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  24.11 
 
 
553 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  30.73 
 
 
560 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.68 
 
 
570 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.75 
 
 
535 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.24 
 
 
556 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  24.59 
 
 
776 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.5 
 
 
417 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.21 
 
 
1147 aa  81.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  29.77 
 
 
726 aa  81.3  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.68 
 
 
1848 aa  81.3  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  25.97 
 
 
593 aa  80.5  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  25.11 
 
 
2082 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.52 
 
 
469 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  26.12 
 
 
900 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  25.22 
 
 
577 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  27.81 
 
 
783 aa  79  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  26.45 
 
 
558 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  28.24 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.67 
 
 
563 aa  77.8  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.95 
 
 
555 aa  77.4  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  23.41 
 
 
717 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  28.24 
 
 
363 aa  77  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  30.73 
 
 
551 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  28.77 
 
 
643 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  23.19 
 
 
714 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  26.74 
 
 
727 aa  74.3  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  25.52 
 
 
681 aa  74.3  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  26.3 
 
 
1187 aa  73.9  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.07 
 
 
787 aa  73.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  23.91 
 
 
566 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  23.85 
 
 
911 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.19 
 
 
567 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.49 
 
 
553 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  28 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  27.43 
 
 
403 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  25.28 
 
 
1312 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  27.64 
 
 
737 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.84 
 
 
1919 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  22.66 
 
 
461 aa  68.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24.23 
 
 
728 aa  68.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  27.93 
 
 
643 aa  67.4  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6750  predicted protein  29.95 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0046022  normal  0.726599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  30.8 
 
 
558 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  23.7 
 
 
449 aa  67  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  24.86 
 
 
328 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  26.81 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36476  predicted protein  27.98 
 
 
520 aa  65.1  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  26.77 
 
 
807 aa  64.7  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.93 
 
 
692 aa  65.1  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02874  conserved hypothetical protein  22.29 
 
 
1365 aa  64.3  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.46357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  22.25 
 
 
1679 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  26.23 
 
 
597 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  25.48 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  25.23 
 
 
1222 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.65 
 
 
817 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  28.3 
 
 
544 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  23.96 
 
 
657 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  22.44 
 
 
547 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  23.79 
 
 
461 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  28.15 
 
 
394 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.97 
 
 
326 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.85 
 
 
454 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  25.4 
 
 
450 aa  57  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  29.12 
 
 
447 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 
518 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  21.89 
 
 
1129 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  24.44 
 
 
618 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47675  predicted protein  23.81 
 
 
491 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  28.77 
 
 
332 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.35 
 
 
209 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  30.13 
 
 
454 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  31.68 
 
 
106 aa  55.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10609  mitochondrial protein Fmp25, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11100)  25.19 
 
 
575 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.730659  normal  0.181462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  24.81 
 
 
624 aa  53.9  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>