136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  100 
 
 
737 aa  1452    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  38.98 
 
 
900 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  38.48 
 
 
1848 aa  197  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.01 
 
 
554 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  36.46 
 
 
477 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  40 
 
 
784 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  39.32 
 
 
778 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  40.66 
 
 
553 aa  184  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  39.78 
 
 
579 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.88 
 
 
561 aa  181  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  39.64 
 
 
792 aa  180  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.16 
 
 
556 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.19 
 
 
563 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  38.02 
 
 
776 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  33.17 
 
 
911 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  35.2 
 
 
1129 aa  172  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  37.91 
 
 
551 aa  172  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  37.85 
 
 
560 aa  171  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  38.1 
 
 
558 aa  169  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.5 
 
 
570 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.33 
 
 
555 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.76 
 
 
821 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  33.92 
 
 
593 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.6 
 
 
567 aa  161  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  39.29 
 
 
546 aa  160  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  34.2 
 
 
743 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  30.79 
 
 
461 aa  158  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.68 
 
 
818 aa  157  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  38.01 
 
 
2082 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  37.04 
 
 
569 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  33.49 
 
 
714 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.79 
 
 
1919 aa  154  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.58 
 
 
837 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  36.73 
 
 
443 aa  152  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.21 
 
 
1679 aa  151  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  35.45 
 
 
577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.04 
 
 
555 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  34.58 
 
 
554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  35.26 
 
 
558 aa  147  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  31.69 
 
 
461 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.03 
 
 
417 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  39.46 
 
 
566 aa  142  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  32.47 
 
 
403 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  31.51 
 
 
341 aa  137  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  32.17 
 
 
363 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  32.77 
 
 
717 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  31.9 
 
 
363 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  29.41 
 
 
807 aa  133  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  35.9 
 
 
835 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.9 
 
 
553 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  30.96 
 
 
418 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  35.33 
 
 
376 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.24 
 
 
469 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  35.92 
 
 
681 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  34.51 
 
 
389 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  32.71 
 
 
638 aa  124  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  30.77 
 
 
449 aa  122  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.32 
 
 
706 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  29.78 
 
 
726 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  28.87 
 
 
1207 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  31.09 
 
 
547 aa  112  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
745 aa  111  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  29.74 
 
 
328 aa  110  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  27.32 
 
 
575 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  28.14 
 
 
1187 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.25 
 
 
817 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  27.08 
 
 
728 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.97 
 
 
787 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  27.24 
 
 
375 aa  103  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.97 
 
 
692 aa  101  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  28.34 
 
 
558 aa  95.5  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.07 
 
 
810 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  29.48 
 
 
602 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.36 
 
 
1147 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  27.51 
 
 
727 aa  92.8  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  26.43 
 
 
390 aa  91.7  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  25.95 
 
 
399 aa  91.7  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.78 
 
 
941 aa  91.3  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  30.83 
 
 
643 aa  91.3  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  32.03 
 
 
1312 aa  90.5  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  26.7 
 
 
396 aa  89.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  29.08 
 
 
544 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  26.74 
 
 
783 aa  87.8  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.19 
 
 
1126 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  39.67 
 
 
1100 aa  85.9  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  29.41 
 
 
618 aa  84.7  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.99 
 
 
535 aa  84.7  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  25 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.58 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  26.58 
 
 
1222 aa  80.9  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  26.85 
 
 
597 aa  80.1  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  24.86 
 
 
643 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  25.66 
 
 
447 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  26.4 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  26.48 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  24.02 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  27.5 
 
 
657 aa  75.5  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  29.1 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  26.93 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  39.42 
 
 
106 aa  72  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>