87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_51473 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_51473  predicted protein  100 
 
 
1448 aa  2979    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.391581 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02073  BTB domain and ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04760)  28.15 
 
 
1680 aa  203  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.768919 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03920  conserved hypothetical protein  22.59 
 
 
1284 aa  141  7.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568739  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  24.01 
 
 
1312 aa  76.3  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  28.1 
 
 
418 aa  73.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  28.42 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.33 
 
 
563 aa  72.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  26.54 
 
 
737 aa  71.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  29.95 
 
 
553 aa  71.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.03 
 
 
561 aa  71.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  27.98 
 
 
727 aa  69.7  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.07 
 
 
821 aa  68.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  26.62 
 
 
341 aa  67  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.14 
 
 
554 aa  65.9  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.79 
 
 
818 aa  65.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  30.22 
 
 
569 aa  63.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.5 
 
 
1848 aa  63.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  28.57 
 
 
579 aa  63.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  27.75 
 
 
332 aa  63.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  24.88 
 
 
784 aa  60.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  22.89 
 
 
2082 aa  58.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.35 
 
 
1919 aa  58.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  30.87 
 
 
551 aa  57.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  25.59 
 
 
714 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  30.77 
 
 
558 aa  57.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  28.08 
 
 
593 aa  57.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  28.57 
 
 
577 aa  57.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.67 
 
 
567 aa  57  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.99 
 
 
706 aa  57  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6750  predicted protein  39.53 
 
 
212 aa  56.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0046022  normal  0.726599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  26.76 
 
 
558 aa  56.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  29.86 
 
 
390 aa  56.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  29.66 
 
 
560 aa  56.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  24.52 
 
 
778 aa  55.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  25.96 
 
 
546 aa  55.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  38.04 
 
 
328 aa  55.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  24.58 
 
 
717 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47675  predicted protein  26.95 
 
 
491 aa  54.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  26.21 
 
 
900 aa  54.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  21.95 
 
 
1679 aa  54.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  25.96 
 
 
792 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.31 
 
 
556 aa  53.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.19 
 
 
555 aa  53.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  30.66 
 
 
566 aa  53.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.7 
 
 
555 aa  53.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.34 
 
 
417 aa  53.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  23.84 
 
 
399 aa  53.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  23.02 
 
 
1207 aa  53.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  28.57 
 
 
547 aa  53.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  25.66 
 
 
394 aa  53.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.68 
 
 
692 aa  53.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 
518 aa  52.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  22.98 
 
 
911 aa  52.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  21.37 
 
 
461 aa  52.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  27.4 
 
 
776 aa  52  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24 
 
 
728 aa  50.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  28.08 
 
 
477 aa  50.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  27.03 
 
 
499 aa  50.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  22.83 
 
 
1126 aa  50.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42978  predicted protein  22.07 
 
 
632 aa  50.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  23.72 
 
 
1147 aa  50.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  23.64 
 
 
941 aa  49.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  26.62 
 
 
554 aa  49.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  24.76 
 
 
403 aa  48.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  24.78 
 
 
726 aa  48.5  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  25.35 
 
 
643 aa  48.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  26.26 
 
 
533 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.96 
 
 
817 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  23.48 
 
 
1187 aa  48.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  26.83 
 
 
443 aa  48.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.34 
 
 
209 aa  48.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  22.12 
 
 
547 aa  48.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  22.76 
 
 
783 aa  48.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  28.24 
 
 
450 aa  47.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  26.13 
 
 
558 aa  47.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  28.75 
 
 
743 aa  47  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.96 
 
 
787 aa  47  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.21 
 
 
535 aa  47  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02874  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 
1365 aa  46.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.46357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.48 
 
 
454 aa  46.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.87 
 
 
570 aa  46.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  23.15 
 
 
618 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  28.06 
 
 
363 aa  45.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  28.06 
 
 
363 aa  45.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  24.64 
 
 
1129 aa  45.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  27.04 
 
 
643 aa  45.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  30.3 
 
 
681 aa  45.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>