109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI02340 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  1065    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  27.61 
 
 
399 aa  124  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  29.57 
 
 
657 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  29.04 
 
 
418 aa  87.4  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  29.23 
 
 
569 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.82 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.1 
 
 
554 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  34.1 
 
 
546 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.29 
 
 
818 aa  70.5  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.14 
 
 
563 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  34.13 
 
 
553 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  30 
 
 
743 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  33.73 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  25.9 
 
 
558 aa  67.4  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.53 
 
 
567 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  26.15 
 
 
375 aa  67  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.9 
 
 
821 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.93 
 
 
555 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  39.36 
 
 
900 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.69 
 
 
570 aa  65.1  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  35.4 
 
 
737 aa  64.7  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  36.13 
 
 
726 aa  64.3  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  31.11 
 
 
560 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  24.76 
 
 
328 aa  64.3  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  27.85 
 
 
499 aa  63.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  32.32 
 
 
558 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.32 
 
 
1848 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.57 
 
 
706 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  52 
 
 
1474 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  29.47 
 
 
778 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  32.26 
 
 
792 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.97 
 
 
692 aa  61.6  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  29.53 
 
 
776 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.1 
 
 
555 aa  61.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.07 
 
 
837 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.13 
 
 
561 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  33.77 
 
 
363 aa  60.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  33.77 
 
 
363 aa  60.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  28.29 
 
 
2082 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  30.29 
 
 
643 aa  60.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  25.5 
 
 
403 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  31.85 
 
 
593 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  33.71 
 
 
844 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45954  predicted protein  48.98 
 
 
1041 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  28.74 
 
 
551 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  25 
 
 
1679 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  28.52 
 
 
579 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  30.34 
 
 
784 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  31.18 
 
 
554 aa  58.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.6 
 
 
556 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  27.36 
 
 
911 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  30.32 
 
 
1312 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  34.55 
 
 
727 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.03 
 
 
454 aa  57  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  44.9 
 
 
1858 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.8 
 
 
469 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119675  TrxG-related PHD-finger protein  40.3 
 
 
705 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  28.93 
 
 
547 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36476  predicted protein  31.11 
 
 
520 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  28.57 
 
 
590 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  25.38 
 
 
807 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  33.54 
 
 
577 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6750  predicted protein  30.97 
 
 
212 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0046022  normal  0.726599 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  25.64 
 
 
533 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.77 
 
 
1919 aa  54.3  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  33.33 
 
 
1717 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  29.05 
 
 
566 aa  54.3  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  30.23 
 
 
558 aa  53.9  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  42.11 
 
 
784 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  44.44 
 
 
1544 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  44.44 
 
 
1544 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42820  predicted protein  47.62 
 
 
419 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749474  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  30.28 
 
 
390 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42822  predicted protein  44.44 
 
 
837 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.35 
 
 
1147 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51473  predicted protein  24.68 
 
 
1448 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  22.73 
 
 
461 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  28.47 
 
 
394 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  23.44 
 
 
443 aa  50.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.33 
 
 
209 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45987  predicted protein  29.41 
 
 
2344 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.76 
 
 
787 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  29.23 
 
 
714 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  27.52 
 
 
1222 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  33.12 
 
 
681 aa  50.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  30.09 
 
 
547 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  30.68 
 
 
1207 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  32.85 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  30.9 
 
 
450 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10609  mitochondrial protein Fmp25, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11100)  28.42 
 
 
575 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.730659  normal  0.181462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.57 
 
 
817 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  34.62 
 
 
1187 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 
940 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  22.82 
 
 
341 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59773  conserved hypothetical protein  50 
 
 
651 aa  47  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07300  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16810)  50 
 
 
841 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202225  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  29.52 
 
 
728 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.73 
 
 
553 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.01 
 
 
1126 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  27.17 
 
 
643 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>