18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59773 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_59773  conserved hypothetical protein  100 
 
 
651 aa  1339    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07300  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16810)  34.29 
 
 
841 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202225  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01970  nucleus protein, putative  34.58 
 
 
511 aa  118  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42822  predicted protein  27.37 
 
 
837 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  38.33 
 
 
1474 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43159  predicted protein  36.62 
 
 
2413 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280738  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45954  predicted protein  34.21 
 
 
1041 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  35.85 
 
 
462 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119675  TrxG-related PHD-finger protein  35.59 
 
 
705 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48479  predicted protein  36.51 
 
 
976 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  37.74 
 
 
1544 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  37.74 
 
 
1544 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0363694 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  39.58 
 
 
1717 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  50 
 
 
518 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  34.85 
 
 
784 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  36.73 
 
 
1255 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  27.63 
 
 
844 aa  43.9  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44453  predicted protein  29.58 
 
 
589 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>