30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_17878 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  100 
 
 
1544 aa  3141    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  100 
 
 
1544 aa  3141    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0363694 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  29.93 
 
 
1717 aa  261  7e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 
1858 aa  255  4.0000000000000004e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48747  predicted protein  32.46 
 
 
667 aa  212  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30668  predicted protein  31.09 
 
 
550 aa  212  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  30.95 
 
 
844 aa  186  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32976  predicted protein  28.61 
 
 
1194 aa  177  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.878376  normal  0.932901 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01060  histone demethylase (Eurofung)  34.97 
 
 
1405 aa  101  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135287  normal  0.0812629 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02640  specific transcriptional repressor, putative  37.69 
 
 
1131 aa  99.4  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.430666  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86017  predicted protein  30.19 
 
 
654 aa  92.4  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48109  predicted protein  38.85 
 
 
857 aa  90.5  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85882  protein involved in cell wall biogenesis and architecture  23.31 
 
 
1699 aa  75.5  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134304 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  52.17 
 
 
614 aa  67.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0466722 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119675  TrxG-related PHD-finger protein  53.33 
 
 
705 aa  67.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42822  predicted protein  42.86 
 
 
837 aa  63.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  42.22 
 
 
940 aa  58.9  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  40.48 
 
 
784 aa  58.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  35.64 
 
 
1474 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42820  predicted protein  32 
 
 
419 aa  54.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749474  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18155  predicted protein  41.18 
 
 
444 aa  53.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
518 aa  52.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  38.78 
 
 
462 aa  51.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45954  predicted protein  38.3 
 
 
1041 aa  50.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  37.04 
 
 
1064 aa  48.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07300  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16810)  26.14 
 
 
841 aa  47.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202225  normal  0.238789 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06675  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05250)  35.85 
 
 
1173 aa  47.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0408152 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43159  predicted protein  42.22 
 
 
2413 aa  45.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280738  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01970  nucleus protein, putative  29.8 
 
 
511 aa  45.8  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29003  predicted protein  38 
 
 
831 aa  45.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.596418  normal  0.417698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>