24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43517 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  100 
 
 
1255 aa  2611    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  42.86 
 
 
636 aa  66.2  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  30.51 
 
 
904 aa  65.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  35.63 
 
 
808 aa  60.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37523  predicted protein  32.22 
 
 
1325 aa  60.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.706155  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  36.89 
 
 
610 aa  58.5  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01970  nucleus protein, putative  48.08 
 
 
511 aa  58.2  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  33.71 
 
 
1603 aa  55.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  27.55 
 
 
88 aa  55.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  30.43 
 
 
1056 aa  52.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  30.68 
 
 
634 aa  51.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  34.72 
 
 
71 aa  51.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  33.33 
 
 
2426 aa  49.7  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  34.15 
 
 
1711 aa  49.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30140  predicted protein  31.18 
 
 
128 aa  49.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43159  predicted protein  38.36 
 
 
2413 aa  49.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280738  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  33.33 
 
 
1386 aa  48.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48135  predicted protein  30.48 
 
 
840 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525832  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  27.27 
 
 
1275 aa  46.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  26.76 
 
 
859 aa  45.8  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  29.49 
 
 
873 aa  45.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  38.78 
 
 
462 aa  45.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  24.34 
 
 
1558 aa  45.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07300  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16810)  39.13 
 
 
841 aa  44.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202225  normal  0.238789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>