31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7969 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  100 
 
 
71 aa  146  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30140  predicted protein  55.07 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39662  predicted protein  41.79 
 
 
211 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  41.94 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  41.1 
 
 
904 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  39.44 
 
 
1603 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  37.14 
 
 
1056 aa  54.3  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  41.94 
 
 
1106 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  36.92 
 
 
455 aa  51.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  36.07 
 
 
636 aa  51.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  34.72 
 
 
1255 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  35.71 
 
 
1100 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  37.84 
 
 
1558 aa  48.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  35.71 
 
 
873 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  37.68 
 
 
610 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  32.84 
 
 
808 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  36.36 
 
 
859 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  38.1 
 
 
812 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  39.68 
 
 
678 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  31.88 
 
 
1275 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  38.33 
 
 
414 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  37.68 
 
 
1711 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  40 
 
 
634 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  31.88 
 
 
1566 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13787  predicted protein  39.44 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166601  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  34.29 
 
 
2426 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  32.76 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  33.33 
 
 
338 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  32.39 
 
 
350 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7966  predicted protein  37.5 
 
 
59 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  30.3 
 
 
447 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>