32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06400 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  100 
 
 		 678 aa  1396    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42490  predicted protein  26.17 
 
 		 616 aa  82  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.814262 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  33.33 
 
 		 1407 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  33.59 
 
 		 1566 aa  71.6  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  37.5 
 
 		 1259 aa  71.6  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  35.45 
 
 		 884 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1558 aa  68.2  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76726  predicted protein  42.27 
 
 		 796 aa  68.2  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  24.24 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  40.86 
 
 		 634 aa  60.1  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  36 
 
 		 995 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93058  predicted protein  30.97 
 
 		 1329 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421971  normal  0.543331 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  42.37 
 
 		 1100 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  37.5 
 
 		 88 aa  54.3  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  31.15 
 
 		 873 aa  53.9  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  36.54 
 
 		 859 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  30.43 
 
 		 455 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  39.34 
 
 		 350 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  20.73 
 
 		 808 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  34.78 
 
 		 812 aa  50.8  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  35.38 
 
 		 2426 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  32.39 
 
 		 1422 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  34.38 
 
 		 1275 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  33.85 
 
 		 1603 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  26.29 
 
 		 1056 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  33.9 
 
 		 447 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  38.46 
 
 		 904 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  39.68 
 
 		 71 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  34.38 
 
 		 82 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  35.21 
 
 		 338 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  36.96 
 
 		 1711 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  40.68 
 
 		 1106 aa  44.3  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>