28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30140 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_30140  predicted protein  100 
 
 		 128 aa  265  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  55.07 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  35 
 
 		 636 aa  68.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  35.92 
 
 		 904 aa  65.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  40.62 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  29.63 
 
 		 1056 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  32.63 
 
 		 873 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  36.84 
 
 		 859 aa  57  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  35.87 
 
 		 610 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13787  predicted protein  40 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166601  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  33.33 
 
 		 1603 aa  55.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  31 
 
 		 812 aa  53.9  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  29.89 
 
 		 455 aa  52  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  38.1 
 
 		 2426 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  29.17 
 
 		 808 aa  50.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  35.38 
 
 		 338 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  35.96 
 
 		 1711 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  31.18 
 
 		 1255 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  31.76 
 
 		 1100 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  36.21 
 
 		 1386 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  29.63 
 
 		 414 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  25.24 
 
 		 1422 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  26.21 
 
 		 447 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  28.57 
 
 		 1275 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02200  hypothetical protein  33.85 
 
 		 829 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39662  predicted protein  32.47 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 		 634 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  35.21 
 
 		 1106 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>