More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02380 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  100 
 
 
1275 aa  2590    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  32.73 
 
 
636 aa  176  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51318  essential for cell growth and replication of M dsRNA virus contains four beta-transducin repeats  32.17 
 
 
419 aa  167  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  32.23 
 
 
808 aa  153  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32777  predicted protein  27.12 
 
 
461 aa  110  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535104  normal  0.359872 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04471  60S ribosome biogenesis protein Mak11, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07570)  24.05 
 
 
496 aa  101  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00650253  normal  0.282575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  35.29 
 
 
728 aa  89.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  32.79 
 
 
1523 aa  85.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.5 
 
 
676 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  34.25 
 
 
1364 aa  83.2  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34 
 
 
792 aa  82.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.18 
 
 
1652 aa  82.4  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.1 
 
 
596 aa  82.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  30.86 
 
 
484 aa  82  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  36.59 
 
 
778 aa  81.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  38.1 
 
 
1416 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  30.93 
 
 
1454 aa  79.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.99 
 
 
576 aa  79.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.87 
 
 
1262 aa  79  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  33.6 
 
 
335 aa  79  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  31.1 
 
 
443 aa  79  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.76 
 
 
1363 aa  78.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  37.93 
 
 
1196 aa  78.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.52 
 
 
1236 aa  78.2  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  36.43 
 
 
1193 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  35.83 
 
 
696 aa  77.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  31.67 
 
 
1163 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.99 
 
 
924 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.43 
 
 
947 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.88 
 
 
1213 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.47 
 
 
630 aa  74.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.5 
 
 
740 aa  74.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  37.41 
 
 
610 aa  73.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 
1474 aa  73.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  33.74 
 
 
954 aa  73.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  30.86 
 
 
1553 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.27 
 
 
1481 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.75 
 
 
1760 aa  73.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.07 
 
 
1247 aa  72.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  29.91 
 
 
565 aa  72  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  30.89 
 
 
473 aa  72.4  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  31.01 
 
 
1221 aa  72  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.43 
 
 
1686 aa  72  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.86 
 
 
1188 aa  71.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.06 
 
 
664 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  35.17 
 
 
344 aa  70.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17974  predicted protein  35.77 
 
 
475 aa  71.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0964806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.4 
 
 
1831 aa  71.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.38 
 
 
1599 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.72 
 
 
682 aa  70.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  25.68 
 
 
589 aa  70.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  32.43 
 
 
1552 aa  70.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.71 
 
 
1208 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  30.71 
 
 
578 aa  69.3  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.87 
 
 
842 aa  69.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  26.83 
 
 
1427 aa  69.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  33.05 
 
 
464 aa  68.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.75 
 
 
1711 aa  68.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.88 
 
 
1004 aa  68.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  29.66 
 
 
657 aa  68.6  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.53 
 
 
1242 aa  68.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  31.2 
 
 
774 aa  68.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  33.61 
 
 
742 aa  68.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.75 
 
 
1240 aa  68.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  26.7 
 
 
1209 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  32.62 
 
 
1330 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
687 aa  67.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.77 
 
 
737 aa  67  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  27.62 
 
 
439 aa  67  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.3 
 
 
1039 aa  67  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  31.09 
 
 
782 aa  67  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  33.57 
 
 
1510 aa  67.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.44 
 
 
675 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05910  hypothetical protein  27.2 
 
 
949 aa  67.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.07 
 
 
698 aa  67.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  29.32 
 
 
813 aa  67  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  28.49 
 
 
505 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.61 
 
 
677 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.69 
 
 
1190 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  31.68 
 
 
1357 aa  67.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.96 
 
 
642 aa  67.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01468  pre-mRNA splicing factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04590)  26.54 
 
 
521 aa  66.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559626  hitchhiker  0.00529797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  32 
 
 
1164 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  29.91 
 
 
1714 aa  66.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  31.03 
 
 
316 aa  66.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  36.21 
 
 
1858 aa  66.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.71 
 
 
1868 aa  66.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  34.51 
 
 
1373 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  30.7 
 
 
346 aa  66.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  36.73 
 
 
678 aa  65.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.39 
 
 
1656 aa  65.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  34.48 
 
 
522 aa  65.9  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  33.1 
 
 
344 aa  65.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.37 
 
 
1557 aa  65.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  34.71 
 
 
872 aa  65.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  31.47 
 
 
317 aa  65.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  33.61 
 
 
1161 aa  65.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  33.61 
 
 
1161 aa  65.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.06 
 
 
930 aa  65.1  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  32.82 
 
 
1484 aa  65.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>