42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_73625 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  100 
 
 		 636 aa  1292    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  35.9 
 
 		 808 aa  260  4e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  30 
 
 		 1275 aa  205  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  30.95 
 
 		 859 aa  90.9  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  41.58 
 
 		 610 aa  88.6  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  44.44 
 
 		 1603 aa  85.1  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  41.3 
 
 		 1056 aa  83.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  46.43 
 
 		 1711 aa  81.6  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13787  predicted protein  40.82 
 
 		 190 aa  77  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166601  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  28.04 
 
 		 1386 aa  74.3  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  34.48 
 
 		 904 aa  73.9  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  37.23 
 
 		 2426 aa  72  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  23.58 
 
 		 678 aa  67.8  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  38.75 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  42.86 
 
 		 1255 aa  67.4  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  39.24 
 
 		 812 aa  65.5  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  33.33 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30140  predicted protein  34.62 
 
 		 128 aa  64.7  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  37.33 
 
 		 88 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44609  predicted protein  37.33 
 
 		 1541 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  38.67 
 
 		 1422 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  31.78 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  39.34 
 
 		 634 aa  58.5  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  43.75 
 
 		 1100 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  37.33 
 
 		 82 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42490  predicted protein  24.41 
 
 		 616 aa  54.7  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  27.78 
 
 		 873 aa  54.3  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  36.07 
 
 		 71 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1558 aa  50.8  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  29.21 
 
 		 338 aa  50.4  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  32.91 
 
 		 1106 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33064  predicted protein  36.14 
 
 		 578 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.868854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14725  predicted protein  29.27 
 
 		 627 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  32.47 
 
 		 350 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94785  predicted protein  28.57 
 
 		 218 aa  47.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02200  hypothetical protein  36.05 
 
 		 829 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7614  predicted protein  35.42 
 
 		 81 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  41.38 
 
 		 1064 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  35.42 
 
 		 884 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45987  predicted protein  30.3 
 
 		 2344 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  35.19 
 
 		 995 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39662  predicted protein  33.33 
 
 		 211 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>