35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03448 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  100 
 
 
884 aa  1819    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76726  predicted protein  35.82 
 
 
796 aa  321  3e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161071  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00780  chromatin remodeling-related protein, putative  27.39 
 
 
619 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  27.56 
 
 
678 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  30.59 
 
 
1407 aa  74.3  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  34.59 
 
 
1566 aa  72  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93058  predicted protein  40.91 
 
 
1329 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421971  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  32.63 
 
 
1558 aa  62  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  38.75 
 
 
634 aa  60.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  47.46 
 
 
1100 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42490  predicted protein  33.94 
 
 
616 aa  59.7  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  29.17 
 
 
1259 aa  59.3  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  36.84 
 
 
455 aa  58.2  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  36.67 
 
 
995 aa  58.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  45.9 
 
 
873 aa  58.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  34.67 
 
 
1422 aa  54.7  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  34.67 
 
 
414 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  34.18 
 
 
812 aa  52.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  22.32 
 
 
1275 aa  52.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  37.68 
 
 
859 aa  52.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  29.41 
 
 
1064 aa  52  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  35.56 
 
 
2426 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  40.28 
 
 
1106 aa  49.3  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  28.26 
 
 
904 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  23.24 
 
 
808 aa  48.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  36.11 
 
 
350 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  35.14 
 
 
1056 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14725  predicted protein  27.04 
 
 
627 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  34.38 
 
 
88 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  26.92 
 
 
1603 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  39.34 
 
 
1711 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  31.34 
 
 
82 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  35.42 
 
 
636 aa  45.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33064  predicted protein  33.75 
 
 
578 aa  44.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.868854  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  38.33 
 
 
447 aa  44.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>