33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42944 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  100 
 
 		 1422 aa  2923    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16923  predicted protein  25.59 
 
 		 1559 aa  89.4  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  30.63 
 
 		 812 aa  68.9  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  32.69 
 
 		 455 aa  67.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  40 
 
 		 873 aa  67.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42490  predicted protein  45.12 
 
 		 616 aa  66.6  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  42.86 
 
 		 82 aa  63.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  34.57 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  39.19 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  29.79 
 
 		 447 aa  58.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  42.86 
 
 		 1100 aa  55.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76726  predicted protein  28.04 
 
 		 796 aa  55.5  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  32.97 
 
 		 338 aa  55.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  34.67 
 
 		 884 aa  54.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7614  predicted protein  38.96 
 
 		 81 aa  53.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  33.01 
 
 		 1407 aa  53.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33064  predicted protein  44.26 
 
 		 578 aa  52.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.868854  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03907  transcription factor TFIID complex 145 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08600)  25.12 
 
 		 1092 aa  52.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161314  normal  0.161887 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  39.81 
 
 		 634 aa  52.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  44.64 
 
 		 808 aa  52.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  31.91 
 
 		 1566 aa  50.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14725  predicted protein  32.39 
 
 		 627 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  27.59 
 
 		 610 aa  48.9  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 		 1711 aa  48.9  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  34.57 
 
 		 1106 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93058  predicted protein  32.99 
 
 		 1329 aa  48.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421971  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05370  transcription initiation factor tfiid 111 kda subunit, putative  32.46 
 
 		 1069 aa  48.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  29.79 
 
 		 904 aa  48.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  32.39 
 
 		 678 aa  48.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  31.58 
 
 		 2426 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  35.48 
 
 		 88 aa  47.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  37.29 
 
 		 1275 aa  45.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  23.21 
 
 		 995 aa  45.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>