28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80611 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  100 
 
 		 1106 aa  2268    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  35.76 
 
 		 1100 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  30.36 
 
 		 873 aa  105  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  46.03 
 
 		 1711 aa  63.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33064  predicted protein  38.89 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.868854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  40.58 
 
 		 88 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  39.02 
 
 		 859 aa  54.3  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  41.94 
 
 		 71 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  37.14 
 
 		 82 aa  52  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  37.66 
 
 		 995 aa  51.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  35.29 
 
 		 338 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  38.96 
 
 		 808 aa  50.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  37.31 
 
 		 455 aa  50.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  35.09 
 
 		 1386 aa  49.7  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  40.38 
 
 		 904 aa  50.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  48.94 
 
 		 1056 aa  49.3  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  32.91 
 
 		 636 aa  49.3  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  35 
 
 		 1064 aa  49.3  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  35.29 
 
 		 350 aa  48.9  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  36.23 
 
 		 634 aa  48.9  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  40.28 
 
 		 884 aa  48.5  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  30.77 
 
 		 414 aa  48.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  32.77 
 
 		 1422 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42490  predicted protein  32.29 
 
 		 616 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  40.35 
 
 		 812 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  33.9 
 
 		 1407 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  28.74 
 
 		 1566 aa  45.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_7961  predicted protein  37.5 
 
 		 59 aa  45.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>