43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7957 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  100 
 
 
88 aa  187  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  42.86 
 
 
859 aa  64.3  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30140  predicted protein  40.62 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  37.33 
 
 
636 aa  63.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  36.99 
 
 
338 aa  60.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  41.94 
 
 
71 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  37.5 
 
 
904 aa  60.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  43.33 
 
 
873 aa  60.1  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  46.43 
 
 
1100 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  41.43 
 
 
1711 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 
634 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  37.63 
 
 
808 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  35.63 
 
 
1603 aa  57.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  35.62 
 
 
1558 aa  57  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  35.71 
 
 
455 aa  57  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  38.67 
 
 
812 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  27.55 
 
 
1255 aa  55.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7614  predicted protein  36.92 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  40.58 
 
 
1106 aa  54.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  33.78 
 
 
414 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  37.5 
 
 
678 aa  52.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  37.18 
 
 
1056 aa  51.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  35.38 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02200  hypothetical protein  35.53 
 
 
829 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  35.9 
 
 
1275 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13787  predicted protein  37.66 
 
 
190 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166601  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  41.38 
 
 
1386 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  35.48 
 
 
1422 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33064  predicted protein  32.43 
 
 
578 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.868854  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  28.36 
 
 
1566 aa  47.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  34.38 
 
 
884 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  31.17 
 
 
2426 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  29.41 
 
 
1407 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  30.38 
 
 
1259 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39662  predicted protein  37.74 
 
 
211 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  32.39 
 
 
995 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  32.39 
 
 
1064 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  30.56 
 
 
447 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13205  predicted protein  28.57 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_7961  predicted protein  33.33 
 
 
59 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  37.88 
 
 
610 aa  40.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42490  predicted protein  30.99 
 
 
616 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14725  predicted protein  33.33 
 
 
627 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>