46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF02300 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  100 
 
 		 1064 aa  2199    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06675  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05250)  40.07 
 
 		 1173 aa  405  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0408152 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29003  predicted protein  32.07 
 
 		 831 aa  281  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.596418  normal  0.417698 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8266  predicted protein  46.53 
 
 		 146 aa  153  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  40.22 
 
 		 1782 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  41.78 
 
 		 495 aa  128  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31122  predicted protein  33.62 
 
 		 1197 aa  114  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44901  predicted protein  31.16 
 
 		 1971 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05730  conserved hypothetical protein  29.65 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.643071  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  37.63 
 
 		 1565 aa  72.8  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51175  hypothetical PHD type zinc finger protein with BAH domain-containing protein  27.55 
 
 		 1442 aa  71.6  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.18336 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  35.23 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  36.84 
 
 		 1056 aa  60.1  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  37.66 
 
 		 1603 aa  59.7  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01060  histone demethylase (Eurofung)  35.48 
 
 		 1405 aa  58.9  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135287  normal  0.0812629 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04229  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06260)  33.71 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.689928  normal  0.847598 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02640  specific transcriptional repressor, putative  31.82 
 
 		 1131 aa  57.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.430666  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  40.58 
 
 		 414 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  32.1 
 
 		 634 aa  56.2  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  30.51 
 
 		 1711 aa  54.3  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14725  predicted protein  27.72 
 
 		 627 aa  54.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  41.67 
 
 		 859 aa  54.3  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  34.69 
 
 		 904 aa  53.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  40 
 
 		 614 aa  52.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0466722 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  29.41 
 
 		 884 aa  52.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  29.25 
 
 		 812 aa  52.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  46.81 
 
 		 2426 aa  52  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33064  predicted protein  30.11 
 
 		 578 aa  51.2  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.868854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  35 
 
 		 1106 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_7961  predicted protein  39.29 
 
 		 59 aa  49.3  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  33.73 
 
 		 1474 aa  48.9  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  35.48 
 
 		 350 aa  48.5  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  37.04 
 
 		 1544 aa  48.1  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  37.04 
 
 		 1544 aa  48.1  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  30.97 
 
 		 873 aa  47.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1558 aa  47.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  30 
 
 		 1717 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  34.78 
 
 		 455 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43159  predicted protein  34.92 
 
 		 2413 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280738  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18155  predicted protein  35.56 
 
 		 444 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  35.21 
 
 		 1275 aa  47.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  39.58 
 
 		 462 aa  45.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  41.38 
 
 		 636 aa  45.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33896  predicted protein  43.9 
 
 		 866 aa  45.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  27.78 
 
 		 808 aa  44.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  35 
 
 		 844 aa  44.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>