18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02640 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH02640  specific transcriptional repressor, putative  100 
 
 		 1131 aa  2348    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.430666  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01060  histone demethylase (Eurofung)  35.48 
 
 		 1405 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135287  normal  0.0812629 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86017  predicted protein  37.7 
 
 		 654 aa  273  9e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48109  predicted protein  42.26 
 
 		 857 aa  207  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32976  predicted protein  39.09 
 
 		 1194 aa  145  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.878376  normal  0.932901 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30668  predicted protein  36.41 
 
 		 550 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  40.51 
 
 		 844 aa  130  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  36.95 
 
 		 1717 aa  126  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  34.3 
 
 		 1858 aa  125  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48747  predicted protein  36.02 
 
 		 667 aa  125  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  37.69 
 
 		 1544 aa  99.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  37.69 
 
 		 1544 aa  99.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85882  protein involved in cell wall biogenesis and architecture  23.11 
 
 		 1699 aa  68.2  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134304 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06675  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05250)  33.04 
 
 		 1173 aa  65.1  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0408152 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  31.82 
 
 		 1064 aa  57.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29003  predicted protein  30.91 
 
 		 831 aa  56.2  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.596418  normal  0.417698 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  31.58 
 
 		 1782 aa  47.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25099  predicted protein  26.95 
 
 		 729 aa  47.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>