14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48109 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48109  predicted protein  100 
 
 		 857 aa  1777    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02640  specific transcriptional repressor, putative  42.32 
 
 		 1131 aa  209  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.430666  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01060  histone demethylase (Eurofung)  43.33 
 
 		 1405 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135287  normal  0.0812629 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86017  predicted protein  42.11 
 
 		 654 aa  177  8e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  31.27 
 
 		 1717 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30668  predicted protein  40.51 
 
 		 550 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32976  predicted protein  36.67 
 
 		 1194 aa  124  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.878376  normal  0.932901 
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  28.89 
 
 		 1858 aa  122  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48747  predicted protein  28.77 
 
 		 667 aa  115  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  37.41 
 
 		 844 aa  105  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  38.85 
 
 		 1544 aa  90.5  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  38.85 
 
 		 1544 aa  90.5  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85882  protein involved in cell wall biogenesis and architecture  27.19 
 
 		 1699 aa  62  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134304 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25099  predicted protein  25.87 
 
 		 729 aa  55.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>