28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88926 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  100 
 
 		 844 aa  1768    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  44.74 
 
 		 1717 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  41.06 
 
 		 1858 aa  278  3e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32976  predicted protein  38.35 
 
 		 1194 aa  223  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.878376  normal  0.932901 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30668  predicted protein  37.76 
 
 		 550 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  30.95 
 
 		 1544 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  30.95 
 
 		 1544 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48747  predicted protein  32.62 
 
 		 667 aa  167  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02640  specific transcriptional repressor, putative  40.51 
 
 		 1131 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.430666  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86017  predicted protein  37.01 
 
 		 654 aa  115  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01060  histone demethylase (Eurofung)  37.01 
 
 		 1405 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135287  normal  0.0812629 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48109  predicted protein  37.41 
 
 		 857 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85882  protein involved in cell wall biogenesis and architecture  23.56 
 
 		 1699 aa  73.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134304 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42822  predicted protein  44.83 
 
 		 837 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  33.71 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119675  TrxG-related PHD-finger protein  43.4 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  45.45 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  43.75 
 
 		 1474 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  43.4 
 
 		 614 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0466722 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45987  predicted protein  28.26 
 
 		 2344 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45954  predicted protein  45.28 
 
 		 1041 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  38.18 
 
 		 784 aa  52  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42820  predicted protein  43.18 
 
 		 419 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749474  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 940 aa  48.9  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07300  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16810)  34.38 
 
 		 841 aa  47.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202225  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25099  predicted protein  26.32 
 
 		 729 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06675  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05250)  38.33 
 
 		 1173 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0408152 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  35 
 
 		 1064 aa  45.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>