23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29003 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_29003  predicted protein  100 
 
 		 831 aa  1722    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.596418  normal  0.417698 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06675  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05250)  35.3 
 
 		 1173 aa  323  6e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0408152 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  32.07 
 
 		 1064 aa  284  5.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8266  predicted protein  47.3 
 
 		 146 aa  150  9e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  37.95 
 
 		 1782 aa  140  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  40 
 
 		 495 aa  124  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31122  predicted protein  33.85 
 
 		 1197 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44901  predicted protein  26.59 
 
 		 1971 aa  95.5  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05730  conserved hypothetical protein  26.73 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.643071  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51175  hypothetical PHD type zinc finger protein with BAH domain-containing protein  24.75 
 
 		 1442 aa  62  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.18336 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  29.52 
 
 		 1565 aa  61.6  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01060  histone demethylase (Eurofung)  35 
 
 		 1405 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135287  normal  0.0812629 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02640  specific transcriptional repressor, putative  30.91 
 
 		 1131 aa  55.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.430666  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04229  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06260)  46.15 
 
 		 681 aa  55.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.689928  normal  0.847598 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  37.25 
 
 		 614 aa  55.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0466722 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43159  predicted protein  38.46 
 
 		 2413 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280738  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  28.16 
 
 		 1474 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18155  predicted protein  37.78 
 
 		 444 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  38 
 
 		 1544 aa  45.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  38 
 
 		 1544 aa  45.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33896  predicted protein  31.75 
 
 		 866 aa  45.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  37.25 
 
 		 462 aa  44.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0104  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  23.03 
 
 		 1199 aa  44.3  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000439156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>