24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85882 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_85882  protein involved in cell wall biogenesis and architecture  100 
 
 		 1699 aa  3472    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134304 
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  22.4 
 
 		 1858 aa  146  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  19.32 
 
 		 1717 aa  128  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32976  predicted protein  27.52 
 
 		 1194 aa  92.8  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.878376  normal  0.932901 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  23.31 
 
 		 1544 aa  75.5  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  23.31 
 
 		 1544 aa  75.5  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  23.56 
 
 		 844 aa  73.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30668  predicted protein  24.89 
 
 		 550 aa  71.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02640  specific transcriptional repressor, putative  23.11 
 
 		 1131 aa  67.8  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.430666  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01620  transcriptional activator, putative  45.1 
 
 		 1242 aa  64.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.722836  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48109  predicted protein  27.19 
 
 		 857 aa  62.4  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48747  predicted protein  25.48 
 
 		 667 aa  58.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01060  histone demethylase (Eurofung)  34.78 
 
 		 1405 aa  58.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135287  normal  0.0812629 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86017  predicted protein  31.15 
 
 		 654 aa  52  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34069  predicted protein  42.59 
 
 		 185 aa  51.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0987823 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  30.48 
 
 		 1432 aa  50.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93625  predicted protein  35.85 
 
 		 609 aa  50.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00774306 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94154  predicted protein  35.85 
 
 		 609 aa  50.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000419692  normal  0.0261603 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01390  histone acetylation-related protein, putative  39.29 
 
 		 457 aa  49.3  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.410495  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04210  conserved hypothetical protein  35.44 
 
 		 362 aa  48.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.375052  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29004  predicted protein  28.57 
 
 		 1402 aa  47.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613933  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00900  hypothetical protein  25.26 
 
 		 746 aa  47  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02905  ARID/BRIGHT domain protein (SWI1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11380)  24.51 
 
 		 980 aa  46.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.285462  normal  0.303807 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02850  PHD transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12030)  44 
 
 		 799 aa  45.8  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>