20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33064 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_33064  predicted protein  100 
 
 		 578 aa  1117    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.868854  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  33.08 
 
 		 634 aa  83.6  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  34.65 
 
 		 873 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  36.26 
 
 		 1100 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  38.89 
 
 		 1106 aa  63.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  30.53 
 
 		 859 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  44.26 
 
 		 1422 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  36.9 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  35.87 
 
 		 447 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  30.86 
 
 		 1064 aa  50.4  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  29.55 
 
 		 636 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  32.33 
 
 		 1711 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06284  hypothetical protein  25 
 
 		 926 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.610192  normal  0.151134 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  32.43 
 
 		 88 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  31.4 
 
 		 82 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1558 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  39.68 
 
 		 812 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  30.39 
 
 		 414 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  30.99 
 
 		 1566 aa  44.3  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  40 
 
 		 884 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>