41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_17648 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  100 
 
 
904 aa  1868    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  42.7 
 
 
1603 aa  84.3  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  40 
 
 
1056 aa  82.8  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  38 
 
 
859 aa  80.1  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  43.52 
 
 
610 aa  79  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  38.3 
 
 
447 aa  73.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  32.76 
 
 
636 aa  73.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  40.66 
 
 
1711 aa  71.6  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  35.59 
 
 
634 aa  67  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  29.91 
 
 
808 aa  65.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  30.51 
 
 
1255 aa  65.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30140  predicted protein  35.92 
 
 
128 aa  64.7  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  38.46 
 
 
1386 aa  63.9  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  33.75 
 
 
2426 aa  62  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  30.71 
 
 
1275 aa  61.6  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  32.03 
 
 
1558 aa  60.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  37.5 
 
 
88 aa  60.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  41.1 
 
 
71 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  28.72 
 
 
812 aa  59.7  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  33.33 
 
 
873 aa  57.4  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  30.58 
 
 
455 aa  57.4  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  41.25 
 
 
82 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  33.33 
 
 
338 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  39.13 
 
 
1100 aa  53.9  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13787  predicted protein  33.33 
 
 
190 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166601  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  34.69 
 
 
1064 aa  53.5  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  37.93 
 
 
350 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  34.09 
 
 
414 aa  51.2  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  40.38 
 
 
1106 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  20.63 
 
 
537 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44609  predicted protein  31.76 
 
 
1541 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  28.26 
 
 
884 aa  48.9  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  29.79 
 
 
1422 aa  48.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33064  predicted protein  27.97 
 
 
578 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.868854  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  38.46 
 
 
678 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  32.86 
 
 
1407 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  29.11 
 
 
995 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02200  hypothetical protein  33.88 
 
 
829 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  26.88 
 
 
1566 aa  44.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  33.33 
 
 
436 aa  44.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  31.34 
 
 
529 aa  44.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>