42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33057 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  100 
 
 
447 aa  940    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  42.78 
 
 
455 aa  299  9e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  43.39 
 
 
414 aa  291  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  40 
 
 
812 aa  263  6e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  38.86 
 
 
338 aa  250  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  38.3 
 
 
904 aa  73.9  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  35.56 
 
 
873 aa  64.3  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  33.33 
 
 
636 aa  64.3  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  30.63 
 
 
808 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  35.23 
 
 
1064 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  32.22 
 
 
1603 aa  60.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  31.18 
 
 
1056 aa  60.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  29.79 
 
 
1422 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  27.27 
 
 
1558 aa  57  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  40.68 
 
 
859 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  32.32 
 
 
610 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33064  predicted protein  35.53 
 
 
578 aa  53.5  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.868854  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  39.39 
 
 
82 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2013  N-acetylglutamate synthase  26.49 
 
 
460 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 
634 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  30.84 
 
 
1711 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  31.46 
 
 
2426 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  32.88 
 
 
1407 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  35.48 
 
 
1566 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  33.9 
 
 
678 aa  47.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93058  predicted protein  28.71 
 
 
1329 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421971  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13787  predicted protein  32.56 
 
 
190 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166601  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0664  N-acetylglutamate synthase  33.85 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0813  N-acetylglutamate synthase  33.85 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  38.33 
 
 
884 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  32.5 
 
 
1275 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  24.71 
 
 
459 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  24.71 
 
 
459 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  24.71 
 
 
459 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  24.71 
 
 
459 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  24.71 
 
 
459 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  26.58 
 
 
1255 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  24.71 
 
 
459 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  24.71 
 
 
459 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  32.86 
 
 
1100 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44609  predicted protein  31.52 
 
 
1541 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  25.84 
 
 
88 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>