17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_93058 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009361  OSTLU_93058  predicted protein  100 
 
 		 1329 aa  2734    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421971  normal  0.543331 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  40.91 
 
 		 884 aa  63.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  30.61 
 
 		 1259 aa  58.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  30.97 
 
 		 678 aa  55.8  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  27.34 
 
 		 1566 aa  54.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_25083  predicted protein  44.9 
 
 		 740 aa  51.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.156442  normal  0.477507 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  29.85 
 
 		 995 aa  50.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  27.82 
 
 		 1407 aa  49.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  26.47 
 
 		 808 aa  48.9  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  29.13 
 
 		 859 aa  48.5  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  32.99 
 
 		 1422 aa  48.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  28.71 
 
 		 447 aa  48.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42490  predicted protein  27.27 
 
 		 616 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76726  predicted protein  32.61 
 
 		 796 aa  47  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  27.85 
 
 		 455 aa  46.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  31.53 
 
 		 1056 aa  45.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  31.58 
 
 		 1386 aa  45.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>