45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40548 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  100 
 
 		 455 aa  938    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  65.66 
 
 		 414 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  52.05 
 
 		 812 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  41.8 
 
 		 447 aa  300  5e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  39.47 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  37.25 
 
 		 873 aa  72.8  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  38.75 
 
 		 636 aa  68.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  33.01 
 
 		 1422 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  40 
 
 		 1603 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  43.3 
 
 		 1100 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  31.73 
 
 		 634 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  40.51 
 
 		 82 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  41.03 
 
 		 1711 aa  61.6  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  36.96 
 
 		 808 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  37.04 
 
 		 1056 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  39.39 
 
 		 884 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33064  predicted protein  27.74 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.868854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13787  predicted protein  38.1 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166601  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  39.44 
 
 		 88 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1558 aa  57  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  32.58 
 
 		 904 aa  57  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7614  predicted protein  48.21 
 
 		 81 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  43.55 
 
 		 859 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17718  predicted protein  41.94 
 
 		 1177 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  28.57 
 
 		 1407 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  33.33 
 
 		 1259 aa  53.9  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  28.36 
 
 		 610 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14725  predicted protein  27.78 
 
 		 627 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  38.46 
 
 		 1106 aa  53.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30140  predicted protein  29.89 
 
 		 128 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  36.92 
 
 		 71 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  43.55 
 
 		 2426 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  35.21 
 
 		 678 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13205  predicted protein  37.7 
 
 		 83 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93058  predicted protein  27.85 
 
 		 1329 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421971  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  31.36 
 
 		 1275 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  30.38 
 
 		 1566 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7966  predicted protein  42.37 
 
 		 59 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  35.21 
 
 		 1386 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  34.29 
 
 		 1064 aa  47.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76726  predicted protein  32.1 
 
 		 796 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_7961  predicted protein  41.07 
 
 		 59 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  29.17 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39662  predicted protein  40.98 
 
 		 211 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  33.33 
 
 		 995 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>