41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54505 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  100 
 
 		 1056 aa  2209    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  56.82 
 
 		 1603 aa  934    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24443  predicted protein  35.93 
 
 		 1100 aa  495  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00582257  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  36.07 
 
 		 2426 aa  376  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  47.67 
 
 		 610 aa  85.1  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  40 
 
 		 904 aa  82.8  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  41.76 
 
 		 636 aa  82.4  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  38.46 
 
 		 859 aa  75.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  36.78 
 
 		 634 aa  75.1  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  33.33 
 
 		 1386 aa  72  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  36.67 
 
 		 808 aa  65.1  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  38.75 
 
 		 1566 aa  62.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 1711 aa  61.2  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13787  predicted protein  34.65 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166601  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  39.76 
 
 		 1064 aa  60.1  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  25.49 
 
 		 1407 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  31.18 
 
 		 447 aa  60.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  28.28 
 
 		 414 aa  60.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  37.04 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  32.98 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44609  predicted protein  31.87 
 
 		 1541 aa  58.9  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30140  predicted protein  29.36 
 
 		 128 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  39.02 
 
 		 82 aa  56.6  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  34.04 
 
 		 812 aa  55.8  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  37.7 
 
 		 350 aa  55.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  37.14 
 
 		 71 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  30.43 
 
 		 1255 aa  52.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  32.22 
 
 		 1275 aa  51.6  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  37.18 
 
 		 88 aa  51.2  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1558 aa  51.2  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  48.94 
 
 		 1106 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  35.59 
 
 		 1259 aa  48.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  35.14 
 
 		 884 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  33.85 
 
 		 678 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  44.44 
 
 		 1100 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13205  predicted protein  41.51 
 
 		 83 aa  45.8  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7614  predicted protein  37.5 
 
 		 81 aa  45.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93058  predicted protein  31.53 
 
 		 1329 aa  45.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421971  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14725  predicted protein  27.88 
 
 		 627 aa  44.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16923  predicted protein  33.33 
 
 		 1559 aa  44.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  35.59 
 
 		 995 aa  44.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>