37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45764 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  57.83 
 
 
1056 aa  938    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  100 
 
 
1603 aa  3349    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  37.36 
 
 
2426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24443  predicted protein  36.4 
 
 
1100 aa  320  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00582257  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  46.99 
 
 
634 aa  86.7  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  42.7 
 
 
904 aa  84.7  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  44.44 
 
 
636 aa  84.7  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  48.81 
 
 
610 aa  83.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  29.6 
 
 
859 aa  76.3  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  43.75 
 
 
1386 aa  72  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  47.89 
 
 
1711 aa  71.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  32.38 
 
 
808 aa  70.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  40 
 
 
455 aa  66.2  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44609  predicted protein  36.9 
 
 
1541 aa  65.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  40.23 
 
 
414 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13787  predicted protein  40.21 
 
 
190 aa  62.8  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166601  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  32.22 
 
 
447 aa  60.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  37.66 
 
 
1064 aa  60.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  40 
 
 
812 aa  60.1  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  35.37 
 
 
338 aa  58.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  35.63 
 
 
88 aa  57.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  39.44 
 
 
71 aa  56.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  33.71 
 
 
1255 aa  56.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14725  predicted protein  33.33 
 
 
627 aa  55.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  34.62 
 
 
1566 aa  55.5  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  38.75 
 
 
82 aa  55.5  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  31.82 
 
 
1275 aa  54.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  33.33 
 
 
1407 aa  55.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30140  predicted protein  34.88 
 
 
128 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  37.18 
 
 
350 aa  53.9  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7614  predicted protein  44.07 
 
 
81 aa  50.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13205  predicted protein  33.33 
 
 
83 aa  50.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  30.1 
 
 
1558 aa  48.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  33.85 
 
 
995 aa  48.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  40 
 
 
1100 aa  48.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  33.85 
 
 
678 aa  47  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  30.49 
 
 
884 aa  45.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>