14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44609 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44609  predicted protein  100 
 
 
1541 aa  3198    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  34.02 
 
 
1603 aa  65.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  38.05 
 
 
1386 aa  64.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  30.39 
 
 
1711 aa  60.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  29.63 
 
 
1056 aa  59.7  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  32.04 
 
 
808 aa  59.3  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  37.33 
 
 
636 aa  58.9  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  36.49 
 
 
2426 aa  55.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  30.1 
 
 
610 aa  51.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  30.43 
 
 
904 aa  50.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14725  predicted protein  32.88 
 
 
627 aa  49.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  37.7 
 
 
873 aa  48.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  28.77 
 
 
634 aa  48.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  29.07 
 
 
1275 aa  45.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>