36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_2957 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  100 
 
 		 338 aa  705    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  42.77 
 
 		 414 aa  280  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  39.47 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  38.86 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  39.72 
 
 		 812 aa  248  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  36.99 
 
 		 88 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  32.98 
 
 		 1056 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  44.74 
 
 		 82 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  35.37 
 
 		 1603 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  31.31 
 
 		 808 aa  56.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  32.97 
 
 		 1422 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  33.68 
 
 		 873 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  33.33 
 
 		 904 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  31.87 
 
 		 1711 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  35.29 
 
 		 1106 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  38.89 
 
 		 1100 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  29.21 
 
 		 636 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02200  hypothetical protein  25.49 
 
 		 829 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13787  predicted protein  30.69 
 
 		 190 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166601  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30140  predicted protein  35.38 
 
 		 128 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  30.99 
 
 		 1407 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33064  predicted protein  25 
 
 		 578 aa  47.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.868854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  34.43 
 
 		 1566 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  34.72 
 
 		 1275 aa  46.6  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 		 634 aa  46.2  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  35.21 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2178  Amino-acid N-acetyltransferase  25.86 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  32.43 
 
 		 995 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7614  predicted protein  32.76 
 
 		 81 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  30.23 
 
 		 2426 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13205  predicted protein  32.14 
 
 		 83 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  26.73 
 
 		 1255 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93058  predicted protein  28.57 
 
 		 1329 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421971  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  34.15 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  28.74 
 
 		 610 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7969  predicted protein  33.33 
 
 		 71 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>