24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47334 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  100 
 
 		 350 aa  714    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  40.85 
 
 		 1711 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  42.19 
 
 		 873 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  40.54 
 
 		 812 aa  56.2  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  39.62 
 
 		 859 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  38.98 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  37.18 
 
 		 1603 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  36.76 
 
 		 1100 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  32.14 
 
 		 2426 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  37.93 
 
 		 904 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  39.34 
 
 		 678 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80611  transcription factor, member of the histone acetyltransferase SAGA complex  35.29 
 
 		 1106 aa  49.7  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538787  normal  0.471232 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  28.83 
 
 		 808 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  28.74 
 
 		 634 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  35.48 
 
 		 1064 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  39.62 
 
 		 884 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  32.1 
 
 		 636 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  29.17 
 
 		 455 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  30.14 
 
 		 1407 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14725  predicted protein  36.11 
 
 		 627 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  40 
 
 		 995 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  34.15 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29038  predicted protein  34.38 
 
 		 1281 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.985695  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  30.56 
 
 		 82 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>