More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_51318 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_51318  essential for cell growth and replication of M dsRNA virus contains four beta-transducin repeats  100 
 
 
419 aa  852    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  31.89 
 
 
1275 aa  155  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04471  60S ribosome biogenesis protein Mak11, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07570)  24.29 
 
 
496 aa  89.7  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00650253  normal  0.282575 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32777  predicted protein  22.37 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535104  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.17 
 
 
924 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.96 
 
 
676 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.3 
 
 
1236 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.81 
 
 
1652 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.82 
 
 
596 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.47 
 
 
947 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  26.1 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.29 
 
 
1364 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  26.44 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.46 
 
 
742 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.67 
 
 
1196 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  21.22 
 
 
1523 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21929  predicted protein  24.24 
 
 
1270 aa  77.8  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  32.9 
 
 
1208 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.6 
 
 
1190 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.24 
 
 
696 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.76 
 
 
698 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.4 
 
 
1163 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  27.1 
 
 
826 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  27.63 
 
 
728 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02380  nuclear matrix protein NMP200, putative  32.62 
 
 
507 aa  73.9  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  29.7 
 
 
657 aa  73.6  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  21.53 
 
 
1211 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  21.4 
 
 
1454 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.39 
 
 
1188 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  28.51 
 
 
578 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  25.81 
 
 
1416 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.66 
 
 
1831 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.99 
 
 
1267 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.98 
 
 
1304 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.84 
 
 
682 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.17 
 
 
1609 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.39 
 
 
1004 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  32.84 
 
 
778 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.52 
 
 
630 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 
1363 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.83 
 
 
564 aa  70.9  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.3 
 
 
1807 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87280  predicted protein  22.63 
 
 
1204 aa  70.1  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0864133  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06197  Nuclear distribution protein nudF [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00664]  31.97 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.992518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.66 
 
 
1193 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.96 
 
 
1213 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  23.79 
 
 
1016 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.42 
 
 
1247 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.86 
 
 
1240 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  25.68 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3199  WD-40 repeat protein  26.11 
 
 
299 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304748  normal  0.316415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  24.13 
 
 
1209 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.41 
 
 
1868 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.14 
 
 
1557 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25.41 
 
 
1280 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  31.43 
 
 
1474 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  31.94 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  23.47 
 
 
1016 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.12 
 
 
1607 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.59 
 
 
930 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.54 
 
 
642 aa  67  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.55 
 
 
1399 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  30.43 
 
 
840 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  24.88 
 
 
1041 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.82 
 
 
1583 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  31.54 
 
 
774 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  25.98 
 
 
439 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77338  predicted protein  23.66 
 
 
922 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98376  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.58 
 
 
1188 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  22.1 
 
 
1242 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  28.89 
 
 
612 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.138944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.58 
 
 
1262 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.48 
 
 
792 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  23.68 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.3 
 
 
677 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  22.19 
 
 
1491 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  29.45 
 
 
1427 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.5 
 
 
1626 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2962  cytochrome c class I  31.3 
 
 
448 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.52 
 
 
1599 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  20.84 
 
 
1367 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.08 
 
 
1760 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2440  WD-40 repeat-containing protein  24.67 
 
 
433 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00410064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 
1344 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.14 
 
 
622 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  25.67 
 
 
418 aa  63.9  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  30.3 
 
 
484 aa  63.9  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  24.57 
 
 
316 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47198  predicted protein  22.44 
 
 
492 aa  63.9  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.459102  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5500  cytochrome c class I  26.34 
 
 
431 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  24.07 
 
 
1330 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.9 
 
 
919 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.19 
 
 
1161 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.6 
 
 
1711 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  25 
 
 
438 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.33 
 
 
842 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 
687 aa  63.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 
954 aa  63.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23077  predicted protein  21.5 
 
 
379 aa  63.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  32.2 
 
 
1217 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>