More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77338 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05972  Coatomer subunit beta', putative (Eurofung)  48.53 
 
 		 853 aa  856    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.296123 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05570  ER to Golgi transport-related protein, putative  44.09 
 
 		 829 aa  759    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446639  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48514  predicted protein  43.46 
 
 		 931 aa  757    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77338  predicted protein  100 
 
 		 922 aa  1887    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27518  predicted protein  43.09 
 
 		 962 aa  736    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  29.61 
 
 		 1205 aa  234  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00480  coatomer alpha subunit, putative  27.73 
 
 		 1222 aa  233  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87280  predicted protein  28.97 
 
 		 1204 aa  221  3.9999999999999997e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0864133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24382  predicted protein  31.43 
 
 		 1222 aa  219  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21929  predicted protein  28.26 
 
 		 1270 aa  213  9e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  33.2 
 
 		 1363 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  31.39 
 
 		 1364 aa  138  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.61 
 
 		 677 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.84 
 
 		 1454 aa  134  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.74 
 
 		 1523 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  29.47 
 
 		 1878 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.93 
 
 		 696 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.76 
 
 		 1163 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  29.25 
 
 		 1193 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.34 
 
 		 1213 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.11 
 
 		 1236 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.33 
 
 		 1652 aa  118  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 		 1557 aa  118  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.6 
 
 		 676 aa  118  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  31.13 
 
 		 1552 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  20.83 
 
 		 1831 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  31.85 
 
 		 578 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 728 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.16 
 
 		 1609 aa  114  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.4 
 
 		 1623 aa  114  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1807 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31.43 
 
 		 1247 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.54 
 
 		 1208 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 1221 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.44 
 
 		 1267 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 		 1411 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1196 aa  111  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1474 aa  111  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 		 577 aa  110  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.94 
 
 		 1188 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.56 
 
 		 1599 aa  108  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.35 
 
 		 576 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1214 aa  107  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  33.17 
 
 		 790 aa  107  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.83 
 
 		 947 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.78 
 
 		 682 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.11 
 
 		 1626 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.71 
 
 		 1598 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.33 
 
 		 1240 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.24 
 
 		 1856 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.34 
 
 		 630 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.3 
 
 		 1901 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.13 
 
 		 1760 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  33.94 
 
 		 657 aa  105  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.42 
 
 		 1553 aa  105  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  29.66 
 
 		 1789 aa  104  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  27.5 
 
 		 505 aa  104  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.97 
 
 		 1367 aa  104  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.61 
 
 		 1868 aa  104  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 		 1686 aa  104  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.6 
 
 		 1684 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.52 
 
 		 742 aa  103  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1190 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.44 
 
 		 1188 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 		 1190 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.74 
 
 		 740 aa  102  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.93 
 
 		 1547 aa  101  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.28 
 
 		 434 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07530  57.7 kda trp-asp repeats containing protein, putative  24.21 
 
 		 523 aa  99.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.45 
 
 		 1357 aa  99.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  29.18 
 
 		 1443 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1211 aa  100  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  33.5 
 
 		 1661 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.2 
 
 		 1217 aa  99.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.46 
 
 		 1161 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.46 
 
 		 1161 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  27.14 
 
 		 617 aa  99  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.61 
 
 		 675 aa  99  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.83 
 
 		 692 aa  99  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.69 
 
 		 596 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.8 
 
 		 1398 aa  98.6  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.55 
 
 		 1711 aa  98.2  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 		 687 aa  98.2  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.6 
 
 		 1416 aa  97.8  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1858 aa  97.8  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1097 aa  97.8  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.42 
 
 		 930 aa  97.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  22.87 
 
 		 317 aa  97.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  32.28 
 
 		 954 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28 
 
 		 1607 aa  97.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  37.31 
 
 		 452 aa  96.3  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.52 
 
 		 698 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.95 
 
 		 1617 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  27.53 
 
 		 418 aa  95.5  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1177 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.86 
 
 		 344 aa  95.1  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.8 
 
 		 1583 aa  95.1  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.32 
 
 		 664 aa  94.7  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.11 
 
 		 1262 aa  94.4  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  25.71 
 
 		 608 aa  94.4  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>