More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02590 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  857    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06197  Nuclear distribution protein nudF [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00664]  50 
 
 
444 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.992518 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  40.54 
 
 
439 aa  294  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  36.36 
 
 
1652 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  36.83 
 
 
1236 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76411  protein with possible role during mitosis  29.4 
 
 
524 aa  219  7.999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  36.32 
 
 
1364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  35.33 
 
 
1363 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  36.14 
 
 
1163 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  37.39 
 
 
696 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  36.69 
 
 
1221 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  40.59 
 
 
1193 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  32.61 
 
 
1474 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  34.63 
 
 
1523 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  39.04 
 
 
947 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  33.61 
 
 
1196 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.86 
 
 
1454 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  34.07 
 
 
1831 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.52 
 
 
676 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.35 
 
 
1868 aa  186  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  36.23 
 
 
1443 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.52 
 
 
630 aa  180  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  36.48 
 
 
434 aa  180  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  36.64 
 
 
344 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.22 
 
 
1686 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.58 
 
 
1557 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  33.52 
 
 
1878 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.13 
 
 
677 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.82 
 
 
1760 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  33 
 
 
1188 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  32.96 
 
 
1789 aa  176  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  31.58 
 
 
657 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31.92 
 
 
1247 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.43 
 
 
1357 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  36.04 
 
 
344 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.54 
 
 
740 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.61 
 
 
1711 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.94 
 
 
1481 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.35 
 
 
1262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  33.46 
 
 
1190 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  37.59 
 
 
742 aa  167  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.07 
 
 
1267 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  34.52 
 
 
1217 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  35.26 
 
 
1510 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.29 
 
 
1208 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  35.69 
 
 
1553 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  35.64 
 
 
577 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  31.06 
 
 
1367 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  32.1 
 
 
1599 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  32.54 
 
 
1552 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.65 
 
 
1807 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.27 
 
 
692 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.53 
 
 
1213 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.12 
 
 
682 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  32.78 
 
 
505 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  31.86 
 
 
1858 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.48 
 
 
930 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.05 
 
 
1609 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  33.55 
 
 
316 aa  152  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  32.99 
 
 
1661 aa  152  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  34.13 
 
 
1229 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  32.67 
 
 
443 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.83 
 
 
1547 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.51 
 
 
1626 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  36.24 
 
 
780 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  32.9 
 
 
1416 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.13 
 
 
1599 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  32.65 
 
 
317 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.55 
 
 
1607 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.11 
 
 
596 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.76 
 
 
664 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.73 
 
 
1598 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  30.46 
 
 
589 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.65 
 
 
1901 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  29.48 
 
 
316 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  30.43 
 
 
1280 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  30.54 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.64 
 
 
1623 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.24 
 
 
1240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.81 
 
 
1188 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  32.12 
 
 
790 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 
1311 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.73 
 
 
576 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  29.48 
 
 
316 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  35.54 
 
 
872 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  28.61 
 
 
316 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 
687 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  33.88 
 
 
1211 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.57 
 
 
1348 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.6 
 
 
919 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.2 
 
 
716 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  29.25 
 
 
316 aa  144  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  33.7 
 
 
335 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  32.01 
 
 
1714 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.67 
 
 
1398 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  28.13 
 
 
1209 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  35.48 
 
 
540 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28.1 
 
 
1411 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  32.87 
 
 
1214 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  28.57 
 
 
774 aa  139  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>