More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3660 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  100 
 
 
1097 aa  2269    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.71 
 
 
1523 aa  301  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.9 
 
 
1454 aa  275  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.75 
 
 
1163 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.18 
 
 
1652 aa  268  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.83 
 
 
1363 aa  267  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.48 
 
 
1831 aa  267  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.02 
 
 
696 aa  261  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.27 
 
 
947 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  29.98 
 
 
1510 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.4 
 
 
830 aa  256  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.25 
 
 
1236 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.22 
 
 
1868 aa  243  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.68 
 
 
1364 aa  242  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.8 
 
 
1553 aa  241  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 
1481 aa  241  8e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  22.72 
 
 
1160 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.73 
 
 
1196 aa  231  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.48 
 
 
1188 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  28.04 
 
 
1229 aa  222  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.38 
 
 
1193 aa  220  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.6 
 
 
1686 aa  220  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.07 
 
 
1557 aa  214  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  27.24 
 
 
1367 aa  213  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 
1474 aa  211  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.12 
 
 
1221 aa  207  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.77 
 
 
1262 aa  207  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.35 
 
 
1161 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.42 
 
 
1552 aa  205  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.96 
 
 
1161 aa  204  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.85 
 
 
1760 aa  201  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.75 
 
 
1443 aa  198  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.49 
 
 
1357 aa  197  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.71 
 
 
1242 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.21 
 
 
1789 aa  196  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  26.11 
 
 
1214 aa  195  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.03 
 
 
1190 aa  194  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.82 
 
 
919 aa  194  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.09 
 
 
902 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  29.39 
 
 
1656 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.89 
 
 
1901 aa  189  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24 
 
 
930 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.82 
 
 
1823 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.22 
 
 
1211 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  24.92 
 
 
1208 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.4 
 
 
1711 aa  185  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.35 
 
 
1684 aa  184  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  27.87 
 
 
1661 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.47 
 
 
1164 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  22.61 
 
 
1484 aa  178  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.89 
 
 
1217 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.68 
 
 
941 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.93 
 
 
1856 aa  175  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.28 
 
 
1213 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.6 
 
 
1205 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.72 
 
 
1617 aa  166  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  26 
 
 
1177 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  21.81 
 
 
728 aa  164  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25.08 
 
 
1714 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.2 
 
 
1348 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.2 
 
 
1583 aa  161  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  24.01 
 
 
1330 aa  160  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.09 
 
 
740 aa  160  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  21.9 
 
 
1280 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.42 
 
 
1247 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.4 
 
 
1004 aa  155  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  22.28 
 
 
1416 aa  154  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.69 
 
 
1807 aa  153  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  26.39 
 
 
1304 aa  152  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.75 
 
 
1609 aa  152  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  31.77 
 
 
577 aa  150  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.22 
 
 
924 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  34.88 
 
 
774 aa  149  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  29.86 
 
 
344 aa  148  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  30.47 
 
 
344 aa  148  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.57 
 
 
1858 aa  147  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  21.15 
 
 
1188 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.57 
 
 
1240 aa  146  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.84 
 
 
677 aa  146  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.08 
 
 
1477 aa  147  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.58 
 
 
1607 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  23.63 
 
 
1176 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.03 
 
 
676 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.17 
 
 
1088 aa  145  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  23.14 
 
 
1344 aa  144  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 
1878 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  24.19 
 
 
1041 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.69 
 
 
1766 aa  142  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  24.02 
 
 
1373 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.45 
 
 
630 aa  141  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  23.56 
 
 
608 aa  140  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  32.35 
 
 
335 aa  140  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  28.22 
 
 
317 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  24.68 
 
 
565 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.13 
 
 
1598 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.27 
 
 
792 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  28.25 
 
 
443 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.3 
 
 
576 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.9 
 
 
1411 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.38 
 
 
1626 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>