More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG03060 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  100 
 
 
473 aa  978    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  55.28 
 
 
452 aa  488  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  61.36 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  60.32 
 
 
324 aa  402  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56432  predicted protein  49.22 
 
 
407 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491701  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  30.79 
 
 
1523 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.43 
 
 
1868 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  31.88 
 
 
1454 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 
1443 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.11 
 
 
664 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.87 
 
 
1652 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  31.74 
 
 
1163 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.1 
 
 
677 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  29.9 
 
 
1474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.76 
 
 
1363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  30.38 
 
 
1236 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  32.89 
 
 
696 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.23 
 
 
630 aa  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 
589 aa  143  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.52 
 
 
1193 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  31.8 
 
 
1364 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  39.51 
 
 
443 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.07 
 
 
676 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  33.47 
 
 
728 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.25 
 
 
1831 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31.15 
 
 
947 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.49 
 
 
1188 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.38 
 
 
1221 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  27.42 
 
 
657 aa  130  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 
1196 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.9 
 
 
596 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.16 
 
 
1213 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.14 
 
 
692 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.13 
 
 
682 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29 
 
 
1188 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.24 
 
 
1686 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.9 
 
 
1357 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.85 
 
 
1240 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.6 
 
 
1557 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.58 
 
 
742 aa  123  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  30.59 
 
 
1789 aa  123  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.82 
 
 
792 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  30.1 
 
 
344 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.73 
 
 
1247 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.64 
 
 
576 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  30.95 
 
 
578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.1 
 
 
434 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.49 
 
 
930 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.85 
 
 
1190 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.3 
 
 
740 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.87 
 
 
1416 aa  117  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.65 
 
 
1208 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.96 
 
 
733 aa  116  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 
577 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.74 
 
 
608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.15 
 
 
1760 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  26.79 
 
 
678 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  30.26 
 
 
1411 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.51 
 
 
698 aa  113  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 
687 aa  113  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.88 
 
 
642 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  27.14 
 
 
618 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.824291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.3 
 
 
1262 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  28.15 
 
 
774 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 
1807 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.35 
 
 
1901 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  25.24 
 
 
778 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.59 
 
 
1711 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  27.99 
 
 
564 aa  110  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  27.82 
 
 
505 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  27.13 
 
 
316 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.72 
 
 
919 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  27.52 
 
 
1367 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.25 
 
 
1242 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  33.18 
 
 
335 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 
1878 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  23.8 
 
 
418 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  25.4 
 
 
522 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67807  F box protein, for ubiquitin- dependent degradation  30.31 
 
 
780 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  25.91 
 
 
346 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  27.27 
 
 
928 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.33 
 
 
344 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.32 
 
 
1823 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.4 
 
 
1214 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  32.18 
 
 
316 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.83 
 
 
1217 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.23 
 
 
1552 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.88 
 
 
574 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.94 
 
 
1510 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  25.59 
 
 
518 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  28.86 
 
 
1427 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  23.6 
 
 
317 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  31.55 
 
 
1553 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.94 
 
 
1481 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.2 
 
 
675 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  25.55 
 
 
523 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01830  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  28.25 
 
 
323 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05517  cell division control protein Cdc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13030)  25.57 
 
 
1038 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.181187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  28.06 
 
 
597 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48514  predicted protein  28.44 
 
 
931 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>