More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01830 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF01830  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  100 
 
 		 323 aa  662    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29215  predicted protein  33.97 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18217  predicted protein  31.65 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00902772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.91 
 
 		 1196 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.33 
 
 		 1652 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.24 
 
 		 1163 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  27.14 
 
 		 696 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  31.33 
 
 		 1363 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  28.21 
 
 		 522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.76 
 
 		 1523 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.25 
 
 		 1454 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  30.41 
 
 		 1236 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.8 
 
 		 947 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  29.19 
 
 		 1364 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.73 
 
 		 930 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.6 
 
 		 1190 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.1 
 
 		 1868 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  28.3 
 
 		 452 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.9 
 
 		 740 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.91 
 
 		 1831 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.09 
 
 		 1686 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  28.9 
 
 		 1474 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 1221 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  32.14 
 
 		 1188 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.9 
 
 		 919 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.08 
 
 		 742 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25.68 
 
 		 1247 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  26.69 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.85 
 
 		 1557 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  26.01 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.48 
 
 		 630 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  29.28 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26 
 
 		 1193 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.19 
 
 		 1240 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  28 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.4 
 
 		 682 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  29.76 
 
 		 1443 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.83 
 
 		 1213 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  29.76 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 1188 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  28.25 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  26.17 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  26.51 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.75 
 
 		 676 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.39 
 
 		 1901 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  29.54 
 
 		 577 aa  99.8  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.76 
 
 		 1711 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.43 
 
 		 1481 aa  99.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1807 aa  99  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  23.93 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.4 
 
 		 1205 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  28.25 
 
 		 1373 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 		 1311 aa  97.1  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1789 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.4 
 
 		 596 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.48 
 
 		 698 aa  96.7  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  26.89 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  28.48 
 
 		 1416 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1214 aa  96.3  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 505 aa  96.3  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 1760 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.44 
 
 		 1242 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 		 954 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.85 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  33.87 
 
 		 813 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.08 
 
 		 728 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  22.86 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  24.62 
 
 		 1280 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  24.92 
 
 		 657 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.47 
 
 		 677 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.82 
 
 		 692 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1552 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.11 
 
 		 576 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  22.6 
 
 		 464 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1041 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.63 
 
 		 664 aa  92.8  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1367 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.19 
 
 		 1553 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.85 
 
 		 1217 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  25.58 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 687 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.94 
 
 		 1164 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  27.52 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  24.35 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  29.8 
 
 		 790 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.73 
 
 		 1004 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1510 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.72 
 
 		 1856 aa  90.1  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.43 
 
 		 1262 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.93 
 
 		 1599 aa  89.7  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.5 
 
 		 1411 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  29.26 
 
 		 578 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  27.97 
 
 		 1348 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1211 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  24.1 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.74 
 
 		 733 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30.8 
 
 		 1714 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.39 
 
 		 434 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.76 
 
 		 1357 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>