More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67807 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_67807  F box protein, for ubiquitin- dependent degradation  100 
 
 
780 aa  1611    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05517  cell division control protein Cdc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13030)  49.87 
 
 
1038 aa  422  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.181187 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06710  ubiquitin-protein ligase, putative  37.97 
 
 
1012 aa  384  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.994255  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  29 
 
 
618 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.824291 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  34.43 
 
 
928 aa  189  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  32.72 
 
 
1523 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  34.07 
 
 
1454 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.98 
 
 
1868 aa  161  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.23 
 
 
1193 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  32.27 
 
 
1163 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  29.11 
 
 
1364 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.75 
 
 
1196 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  30.2 
 
 
696 aa  140  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.05 
 
 
1363 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  29.77 
 
 
1443 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  22.99 
 
 
612 aa  135  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.138944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.18 
 
 
1652 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.23 
 
 
677 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.36 
 
 
1474 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.3 
 
 
1236 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  28.97 
 
 
589 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.75 
 
 
1221 aa  131  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  31.93 
 
 
577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.99 
 
 
1188 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.19 
 
 
947 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.45 
 
 
1831 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.83 
 
 
676 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.2 
 
 
1190 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  26.47 
 
 
678 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.64 
 
 
630 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 
1807 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  29.62 
 
 
728 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.09 
 
 
1188 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.61 
 
 
1901 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.55 
 
 
1557 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  29.21 
 
 
774 aa  117  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 
1686 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.93 
 
 
1789 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06867  Mitochondrial division protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXW3]  27.27 
 
 
654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  0.183492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 
1240 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.94 
 
 
682 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.15 
 
 
1213 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.56 
 
 
434 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.67 
 
 
742 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  27.48 
 
 
1878 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  28.3 
 
 
778 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.33 
 
 
1247 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.27 
 
 
692 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  27.68 
 
 
564 aa  110  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  28.57 
 
 
324 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.08 
 
 
740 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.81 
 
 
919 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.58 
 
 
792 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.34 
 
 
930 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  30.28 
 
 
452 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.75 
 
 
1416 aa  108  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 
687 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  30.88 
 
 
597 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  29.35 
 
 
1411 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.67 
 
 
664 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  28.85 
 
 
316 aa  107  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.25 
 
 
1510 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  30.5 
 
 
473 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.32 
 
 
1211 aa  106  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.45 
 
 
443 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  26.02 
 
 
1208 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.8 
 
 
1609 aa  104  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.7 
 
 
1599 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.67 
 
 
344 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.54 
 
 
1617 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.43 
 
 
1357 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.34 
 
 
733 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  25.78 
 
 
316 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  28.53 
 
 
316 aa  102  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.59 
 
 
1856 aa  101  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 
1311 aa  101  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  29.7 
 
 
589 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.48 
 
 
1760 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.47 
 
 
576 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  29.19 
 
 
1280 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02861  F-box and WD40 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11870)  20.85 
 
 
656 aa  99.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.65 
 
 
1217 aa  99.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  26.22 
 
 
520 aa  99.8  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  26.72 
 
 
1714 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  27.91 
 
 
782 aa  99.4  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.95 
 
 
1262 aa  99  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  23.96 
 
 
1214 aa  98.6  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.59 
 
 
1205 aa  98.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.05 
 
 
1481 aa  98.2  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.71 
 
 
618 aa  98.2  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  34.32 
 
 
1330 aa  97.8  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  22.57 
 
 
464 aa  97.4  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.14 
 
 
1607 aa  97.4  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.81 
 
 
1684 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.67 
 
 
1583 aa  96.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.4 
 
 
1711 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.85 
 
 
596 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.21 
 
 
1623 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.43 
 
 
344 aa  95.1  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  24.25 
 
 
657 aa  95.1  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>