More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56432 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_56432  predicted protein  100 
 
 		 407 aa  842    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491701  normal  0.770378 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  54.84 
 
 		 452 aa  329  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  49.22 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  50.32 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  45.11 
 
 		 324 aa  266  5.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.59 
 
 		 664 aa  152  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.13 
 
 		 1652 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.03 
 
 		 1523 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  28.57 
 
 		 657 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  31.75 
 
 		 1364 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.03 
 
 		 1454 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.08 
 
 		 1868 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.16 
 
 		 630 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.39 
 
 		 1557 aa  129  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  29.97 
 
 		 728 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.93 
 
 		 1363 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  31.7 
 
 		 696 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.99 
 
 		 682 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 1443 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.81 
 
 		 1236 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 1221 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.24 
 
 		 947 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.75 
 
 		 1416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.71 
 
 		 692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.16 
 
 		 930 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.03 
 
 		 1240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.78 
 
 		 1193 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  29.84 
 
 		 589 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25.54 
 
 		 1247 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.76 
 
 		 676 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.34 
 
 		 1213 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.5 
 
 		 1901 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.73 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.49 
 
 		 1163 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.68 
 
 		 742 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.92 
 
 		 698 aa  109  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.23 
 
 		 1262 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.25 
 
 		 740 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 		 687 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.3 
 
 		 677 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.78 
 
 		 1831 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1367 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.99 
 
 		 1188 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1789 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.84 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.92 
 
 		 1188 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.35 
 
 		 578 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1190 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  26.41 
 
 		 678 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.96 
 
 		 675 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  26.26 
 
 		 505 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1807 aa  103  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.54 
 
 		 1196 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 		 1208 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 		 1686 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.74 
 
 		 919 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.09 
 
 		 608 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  26.54 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.1 
 
 		 1481 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.5 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  31.2 
 
 		 778 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.72 
 
 		 1711 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.37 
 
 		 596 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.52 
 
 		 576 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  28.4 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  28.67 
 
 		 774 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  31.13 
 
 		 772 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  31.13 
 
 		 772 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.66 
 
 		 1357 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.44 
 
 		 642 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.33 
 
 		 1856 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.77 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1510 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  26.51 
 
 		 363 aa  98.2  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.44 
 
 		 733 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.25 
 
 		 924 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  33.33 
 
 		 511 aa  97.1  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.33 
 
 		 1547 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.72 
 
 		 716 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  22.56 
 
 		 1242 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.35 
 
 		 1164 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  29.8 
 
 		 618 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.824291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 1623 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.57 
 
 		 1217 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25.31 
 
 		 1280 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.83 
 
 		 1823 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  24.19 
 
 		 1330 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87280  predicted protein  26.6 
 
 		 1204 aa  93.6  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0864133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1211 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  29.19 
 
 		 316 aa  93.6  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.1 
 
 		 1553 aa  93.2  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.97 
 
 		 1760 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1041 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  23.5 
 
 		 522 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.92 
 
 		 1626 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.92 
 
 		 574 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  25.39 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  23.67 
 
 		 464 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  21.79 
 
 		 1552 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>