More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH03370 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  100 
 
 
928 aa  1905    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  56.06 
 
 
618 aa  326  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.824291 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05517  cell division control protein Cdc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13030)  36.49 
 
 
1038 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.181187 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06710  ubiquitin-protein ligase, putative  35.67 
 
 
1012 aa  197  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.994255  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67807  F box protein, for ubiquitin- dependent degradation  34.43 
 
 
780 aa  191  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  36.92 
 
 
1188 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.41 
 
 
1454 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  34.27 
 
 
1474 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.43 
 
 
1868 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  31.34 
 
 
1523 aa  161  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.39 
 
 
947 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.82 
 
 
1193 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.71 
 
 
1196 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  36.25 
 
 
696 aa  151  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  34.93 
 
 
1363 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  34.6 
 
 
1221 aa  147  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  32.91 
 
 
1213 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  34.83 
 
 
1443 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  31.82 
 
 
1236 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  34.51 
 
 
728 aa  144  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  33.06 
 
 
1188 aa  144  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.85 
 
 
676 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  34.43 
 
 
1247 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  37.44 
 
 
742 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.71 
 
 
1652 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.48 
 
 
682 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  36.77 
 
 
1163 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  32.39 
 
 
1831 aa  140  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33.74 
 
 
1807 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.91 
 
 
1190 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.22 
 
 
677 aa  138  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.76 
 
 
930 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  35.53 
 
 
1364 aa  137  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  34.2 
 
 
1280 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  31.46 
 
 
1242 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.73 
 
 
1208 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  33.77 
 
 
317 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  34.89 
 
 
443 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 
316 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.2 
 
 
792 aa  128  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  29.05 
 
 
589 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.83 
 
 
740 aa  128  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 
687 aa  127  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  34.65 
 
 
577 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5471  predicted protein  31.51 
 
 
264 aa  125  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  33.47 
 
 
344 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.08 
 
 
1901 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  28.85 
 
 
657 aa  124  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.86 
 
 
1262 aa  124  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  32.95 
 
 
316 aa  124  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  33.62 
 
 
774 aa  123  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.61 
 
 
576 aa  124  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.88 
 
 
692 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  26.9 
 
 
464 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  34.06 
 
 
505 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  32.46 
 
 
316 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  32 
 
 
1416 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  32.47 
 
 
316 aa  122  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  30.61 
 
 
434 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 
1760 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  34.29 
 
 
678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  31.54 
 
 
522 aa  120  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.69 
 
 
664 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  29.49 
 
 
578 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
1240 aa  118  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  32.22 
 
 
1214 aa  118  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  30.98 
 
 
316 aa  117  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05570  ER to Golgi transport-related protein, putative  31.47 
 
 
829 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.52 
 
 
1686 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  35.22 
 
 
612 aa  116  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.138944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  29.88 
 
 
778 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  29.73 
 
 
1330 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.48 
 
 
1557 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  30.2 
 
 
335 aa  116  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  28.21 
 
 
1484 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  31.93 
 
 
344 aa  115  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.31 
 
 
596 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  33.05 
 
 
335 aa  114  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  30.74 
 
 
1878 aa  114  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42847  predicted protein  31.84 
 
 
984 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.451507  normal  0.305439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.22 
 
 
630 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  32.3 
 
 
772 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  32.32 
 
 
813 aa  112  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  32.3 
 
 
772 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06867  Mitochondrial division protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXW3]  26.36 
 
 
654 aa  112  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  0.183492 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  26.46 
 
 
518 aa  112  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 
418 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  32.78 
 
 
324 aa  111  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02050  sulfur metabolite repression control protein, putative  30.47 
 
 
861 aa  111  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  30.83 
 
 
782 aa  110  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 
511 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.19 
 
 
564 aa  110  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  35.12 
 
 
826 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  30.49 
 
 
346 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46672  WD repeat protein  33.18 
 
 
317 aa  108  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  28.9 
 
 
439 aa  107  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  29.41 
 
 
1041 aa  107  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.38 
 
 
1217 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  27.39 
 
 
473 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.2 
 
 
1211 aa  107  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>