18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42820 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42820  predicted protein  100 
 
 		 419 aa  868    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749474  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42822  predicted protein  49.32 
 
 		 837 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  36.36 
 
 		 1474 aa  66.6  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119675  TrxG-related PHD-finger protein  45.45 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45954  predicted protein  51.11 
 
 		 1041 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  36.26 
 
 		 1717 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  32 
 
 		 1544 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  32 
 
 		 1544 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  46.67 
 
 		 462 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 1858 aa  53.5  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  47.62 
 
 		 518 aa  53.5  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  43.18 
 
 		 844 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  38.1 
 
 		 940 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45987  predicted protein  44.12 
 
 		 2344 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44453  predicted protein  40 
 
 		 589 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18155  predicted protein  28.87 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  41.86 
 
 		 784 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89717  predicted protein  32.47 
 
 		 383 aa  44.3  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0641021  normal  0.293302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>