31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00240 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  100 
 
 
940 aa  1954    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05640  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10910)  50.46 
 
 
1068 aa  321  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.814217  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50903  predicted protein  59.35 
 
 
553 aa  257  6e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03160  hypothetical protein  54.15 
 
 
564 aa  249  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.283116  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10956  histone acetyltransferase catalytic subunit (Eurofung)  53.92 
 
 
508 aa  240  8e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0558493  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33631  predicted protein  44.03 
 
 
412 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0827491  normal  0.813084 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82300  predicted protein  45.69 
 
 
516 aa  235  3e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284716  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3062  predicted protein  44.1 
 
 
349 aa  225  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0291461  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34656  predicted protein  49.05 
 
 
417 aa  220  7.999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0290177  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42025  predicted protein  47.89 
 
 
458 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.067727  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51406  predicted protein  40.43 
 
 
297 aa  215  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00500  conserved hypothetical protein  41.71 
 
 
584 aa  161  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03071  histone acetyltransferase (MysT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09610)  33.33 
 
 
363 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.605108 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29380  predicted protein  30.63 
 
 
357 aa  118  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000000817876  normal  0.405165 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  54.35 
 
 
1717 aa  69.3  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  46.94 
 
 
1858 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  42.22 
 
 
1544 aa  58.9  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  42.22 
 
 
1544 aa  58.9  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  32.14 
 
 
784 aa  58.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07300  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16810)  53.19 
 
 
841 aa  57  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202225  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42822  predicted protein  42.22 
 
 
837 aa  56.2  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  39.13 
 
 
1474 aa  54.7  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45954  predicted protein  41.51 
 
 
1041 aa  53.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119675  TrxG-related PHD-finger protein  37.25 
 
 
705 aa  52.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  36.54 
 
 
462 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  40 
 
 
844 aa  48.9  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43159  predicted protein  33.33 
 
 
2413 aa  48.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280738  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45987  predicted protein  43.59 
 
 
2344 aa  48.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 
518 aa  48.1  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42820  predicted protein  38.1 
 
 
419 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749474  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92541  predicted protein  37.5 
 
 
824 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.707438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>